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Bioinformatik-Programm für fortschrittliche Protein- und DNA-Sequenzanalyse. Diese 2 x 2 Wochen voll funktionsfähiger Demo von CLC-Hauptwold-Arbeitsbench aggregiert alle DNA-Sequenzanalysen der CLC-GEN-Werkbank und alle Proteinsequenzanalysen von CLC-Protein Workbench.clc-Main Workbench ist ein Werkzeug, das alle Analysen in einem einzelnen, benutzerfreundlichen, benutzerfreundlichen, integriert, und intuitive Softwareanwendung. Hier sind einige wichtige Funktionen von "CLC-Hauptwoldbench": · Montage von DNA-Sequenzierungsdaten. · Advanced Primer Design. · Molekulare Klonierung. · Automatische SNP-Anmerkung von Sequenzen. · Sekundäre Proteinstrukturvorhersage. · Integrierte molekulare 3D-Ansicht. · Signalpeptidvorhersage (SignalP). · Transmembran-Helix-Vorhersage (TMHMM). · Proteinfamilienanalyse (PFAM). · 2 Arten von Ausrichtungen. · Phylogenetik. · Motivsuche (bekannte Muster). · Musterermittlung (unbekannte Muster). · SPRENGEN. · Batch-Verarbeitung mehrerer Analysen in einem Arbeitsschritt. · Punktdiagramme. · Hydrophobizitätsanalysen. · Antigeneranalysen. · Sucht auf Genbank, SwissProt, Trembl und Pubmed. · Detailliertes Protokoll von Aktionen / Analysen. Anforderungen: · 256 MB RAM erforderlich. · 512 MB RAM empfohlen. · 1024 x 768 Anzeige empfohlen. Einschränkungen: · 4 Wochen voll funktionsfähige Probezeit. Was ist neu in dieser Version: Ausdrucksanalyse: · Volcano-Plots: Sie können jetzt die Werte auswählen, um auf der X-Achse aufzutragen. Wählen Sie zwischen "Differenz" und "Fold Change". Weiterlesen... · Die Tabellenansicht von Balkengrundlagen zeigt die gleichen Intervalle, wie sie in der Balkabranz dargestellt sind. · Generischer Importeur für Expression-Array-Daten im tabellarischen Format. Weiterlesen... · Generischer Importeur für Expression-Experiment-Annotationsdaten im tabellarischen Format. Weiterlesen... · Gene Ontology (Go) -Dateien können jetzt verwendet werden, um ein Expressionsexperiment anzusetzen. Weiterlesen... · Tag-Profiling: Sie dürfen nicht mehr Tag-Samples annotieren, nur Experimente · Die Seitenansicht des Experimentiertisches wurde neu organisiert, um einen besseren Überblick bereitzustellen. Weiterlesen... · Die Öffnung der Konsenssequenz einschließlich Lücken wird auch ns, bevor die Konsenssequenz beginnt und nachdem sie endet Einsatz: · Sie können einen Pfad an den Standarddatenstandort einstellen, wenn die Workbench zum ersten Mal beginnt. Dies ist eine Funktion, um Systemadministratoren zu unterstützen, in denen neue Installationen pro Standard, die ihre Daten speichern. Weiterlesen... · Unterstützung beim Entfernen von Tools Zugriff auf das Internet (NCBI-Blast, Aktualisierungsbenachrichtigungen usw.). Weiterlesen... Allgemeiner Import und Export: · Unterstützung für den Import komplexer Regionen aus GFF-Dateien · Exportieren von Tabellen und Berichten in Excel-Format. · Importieren Sie den Abschnitt des Benutzerhandbuchs neu strukturiert, um einen besseren Überblick bereitzustellen. Lesen Sie mehr .... Ausdrucksdatenimporteure werden jetzt in technischen Details in einem separaten Abschnitt beschrieben. Weiterlesen.... · Sie können jetzt mehrere Sequenzlisten in FASTA-Format exportieren · Der erzwungene Import von Zip-Dateien wird jetzt unterstützt (er zwingt den Inhalt der ZIP-Datei importiert) · Der Standardimport akzeptiert jetzt GZIP- und TER-Dateien sowie zip · Wenn ein erzwungener Import fehlschlägt, gibt es mehr technische Informationen darüber, was schief gelaufen ist, wodurch Sie eine schlechte Formatierung der Importdateien identifizieren können · Sowohl Genbank als auch GFF-Importeur versucht jetzt mehrere Versuche, Gene namens zu nennen, die keinen Gennamen haben. Es wird iterativ die folgenden Qualifikation aussuchen: "Produkt", "locus_tag", "protein_id" und "transkript_id" · Beim Importieren von Genbank-Dateien, in denen die angegebene Länge nicht mit der tatsächlichen Reihenfolge übereinstimmt, wird eine Warnung angezeigt, aber die Sequenz wird akzeptiert. · Wenn Sie im CSV-Format exportieren, werden die Gebietsschemaeinstellungen verwendet, um zu bestimmen, ob Komma oder Seitliner als Delimiter verwendet werden sollen (Komma, die für US-Regionen verwendet werden). · Das GFF-Plug-In wurde aktualisiert, um komplexe Anmerkungen zu akzeptieren Sonstig: · Erweiterte Nachrüstung von Anmerkungen mit der Annotationstabelle. Weiterlesen... · Verbesserte Berichterstattung von Situationen, wenn eine vollständige Festplatte das Speichern von Daten verhindert · Herunterladen von Sequenzen mithilfe von Drag & Drop von der Suchabelle erstellt kein "Downloading ..." -Knoten in dem Ordner. Der Download-Prozess kann auf der Registerkarte Prozesse überwacht werden. · Primer-Design unterstützt nun PCR-Fragmente, die länger als 5000 bp sind. · Extrahieren von Sequenzen, die von der Datei MANU in Toolbox-> Allgemeine Reihenfolgeanalyse verschoben werden. Weiterlesen... · Bessere Fortschrittsrückmeldung zu verschiedenen Dialogen Fehlerbehebung: · Problem behoben, das das Beschriftung "Kopieren ..." anzeigt, wenn Sie Daten kopieren und dann den Ordner aktualisieren · Problem mit der Benennung von Registerkarten behoben. Der Fix bedeutet, dass auf Windows- und Linux-Daten jetzt einen * erhält, anstatt den TAB-Namen fett und kursiv zu erstellen. (Dies war immer das Verhalten auf dem Mac OS X).

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