Biomolekül-Toolkit. Biomolekül-Toolkit-Bibliothek zur Modellierung biologischer Makromoleküle wie Proteine, DNA und RNA.
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Biomolekül-Toolkit. Ranking & Zusammenfassung

Biomolekül-Toolkit. Stichworte

Entwurf Analyse Modell Designmolekül Molekülanalyse. Modellmolekül

Biomolekül-Toolkit. Beschreibung

Biomolekül-Toolkit - Bibliothek zur Modellierung biologischer Makromoleküle wie Proteine, DNA und RNA. Das BIOMOLEkULE-Toolkit ist eine Bibliothek zum Modellieren biologischer Makromoleküle wie Proteine, DNA und RNA. Es bietet eine C-Schnittstelle für gemeinsame Aufgaben in der rechnerischen Strukturbiologie, um die Entwicklung molekularer Modellierungs-, Analyse- und Design-Tools zu erleichtern und zu standardisieren. Was ist neu in dieser Version: Zu den wesentlichen Änderungen in dieser Version: · Dokumentationsaktualisierungen. · Zugabe einer umfangreichen Diskussion der Methoden der kleinsten Mindestressings_SuperPosition und der RMSD-Berechnung, einschließlich einer Beschreibung der mathematischen Theorie hinter ihrem Betrieb. · Vollständige dokumentierte Rotations- / Übersetzungsmethoden · Zugabe eines dokumentierten Beispielprogramms ("gyration_radius.cpp") · Fehlerbehebung · Feste Copy Construction-Fehler im PDBATOMDecorator, der Kompilierungsfehler in seltenen Situationen verursachte. · Ein Fehler in PDBFILEPARSER behoben, der einen Kompilationsfehler im PDBSYSTEM-Kopierkonstruktor verursacht hat. · Feste CONST-Conversion-Fehler im Gruppenlochelementteratiker, der die ordnungsgemäße Zusammenstellung von Const- und Nicht-Const-Iteratortypen verhinderte. · Feste Crash-produzierende Fehler in der Stream-Ausgabe für die TypID-Klasse. · Fixiert einen mathematischen Fehler in RMSD- und Überlagerungsmethoden, die die Coordinaten des Moleküls beschädigen würden. · Ein Fehler behoben, der alle standardisierten pdbatom-Objekte verursacht hat, die als HetATMS behandelt werden sollen. · Feature Ergänzungen · Bediener [] zu Atomstruktur und Polymerstruktur abgeleitete Klassen hinzugefügt. · Fügte geschützte Inkrement () und Dekrement-Bediener (), um die Klasse einzugeben. · PDBFILEPARSER kann jetzt PDB-Dateien mit einer schlecht gebildeten Rückstandsnummerierung (d. H. Dateien, in der Rückstandsnummern in aufeinanderfolgenden Ketten wiederholt werden), behandeln.

Biomolekül-Toolkit. Zugehörige Software