Biokoko

Open Source, Objective-C Framework für Parsing- und Schreibfolge-Dateiformate
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Biokoko Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • BioCocoa Team
  • Website des Verlags:
  • http://www.bioinformatics.org/biococoa/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 803 KB

Biokoko Stichworte


Biokoko Beschreibung

Open Source, Objective-C-Framework für Analyse- und Schreib-Sequenzdateiformate BioCocoa ist ein offener Quellquellen- und Objektiv-C-basierter Kakao-Framework für Bioinformatik. Kakao ist ein großartiger Rahmen für die schnelle Anwendungsentwicklung, und es wird daher häufig zur Erstellung innovativer bioskistic-Apps verwendet. Um die Entwicklung noch mehr zu beschleunigen, möchte BioCOCOA wiederverwendbare Kakao-Klassen anbieten, die spezifisch für molekulare Biologie und Biofinformatik sind. Zu diesem Zeitpunkt bietet BioCocoa Modellklassen für biologische Sequenzen, Controller-Klassen für Ausrichtung, Sequenzmanipulation und E / A, Schnittstelle mit Entrez- und Ansichtsklassen, mit denen Sie einfach mit Sequenzen in Ihren eigenen Anwendungen anzeigen und arbeiten können. Was ist neu in dieser Version: · Neue BcSuffixArray- und BCMCP-Klassen zum Erstellen von disternbasierten Suffix-Arrays von Sequenzen und Finden der maximalen gemeinsamen Sequenzenpräfiken mit diesen Suffix-Arrays. · Neue BCCacheDeSequenceFile- und BCCachedFastafile-Klassen, die den Lesen von Sequenzdaten ermöglichen, ohne die gesamte Sequenz in den Speicher zu lesen. Dies ist nützlich, um mit sehr großen Sequenzen wie ganzen Genomen zu arbeiten. Eine zukünftige Freigabe wird eine BCcached-Folge unterstützen, die eine konsistente Sequenzschnittstelle bereitstellt, unabhängig davon, ob sich die Reihenfolge im Speicher befindet oder auf der Festplatte zwischengespeichert ist. · Das Dateiformat kann den BCSequenceReader mit BCFileFormat explizit zur Verfügung gestellt werden. · Dokumentation Updates. · Kompletterer Anschluss an GNUSTEP, alle BCFoundation-Funktionalität sollte verfügbar sein. · Quad-Fat-binäre, unterstützende 32/64-Bit- und PPC / Intel-Prozessoren.


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