Arkadien Eine leichte Desktop-Anwendung, die zum Visualisieren von biologischen Netzwerken wie metabolischen Wegen visualisiert wurde
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Arkadien Ranking & Zusammenfassung

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Arkadien Beschreibung

Eine leichte Desktop-Anwendung, die zum Visualisieren von biologischen Netzwerken wie metabolischen Wegen visualisiert wurde Arcadia ist ein Viewer, kein Editor: Dies bedeutet eine einfachere Schnittstelle, die mehrere Perspektiven auf denselben Daten bietet, mit einem Fokus auf der Navigation. Eine leichte, eigenständige Komponente, Arcadia ist einfach bereitzustellen und zu warten. Um die Interoperabilität mit anderen Werkzeugen zu gewährleisten, wird ein Anstrengungen unternommen, um vorhandene oder aufstrebende Standards wie SBML und SBGN.A Referenzrahmen für die Entwicklung von Arcadia zu unterstützen. Es ist Utopie: ein offener, interoperabler Satz von Desktop-Werkzeugen für die Proteinanalyse, gebaut nach dem Modell / Ansicht / Controller-Muster. Dieser Ansatz entscheidet zusammen mit der objektorientierten Programmierung für flexible, evolutive Software.ARCADIA ist plattformübergreifend und wird hauptsächlich in C ++ entwickelt. Arcadia nutzt leistungsstarke vorhandene Open-Source-Bibliotheken: · libmsbml => Eine Schnittstelle zu SBML-Pathway-Dateien · Die Boost-Graph-Bibliothek => Eine effiziente Grafikstruktur · Graphviz => Klassik-Layout-Algorithmen · Libavoid => Dynamic Edge Routing · qt => Die grafische Benutzeroberfläche hier sind einige wichtige Funktionen von "Arcadia": · Sortierte Reaktionen und biochemische Arten sortiert · Detaillierte Eigenschaften ausgewählter Elemente · Grafische Darstellungen des gesamten Netzwerks · Lokale Karten? Für Gruppen benachbarter Moleküle Anforderungen: · C ++.

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