Annotieren Sie die Reihenfolge mit GFF

Annotieren Sie eine Sequenz mit Anmerkungen aus einer GFF-Datei.
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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • CLC bio
  • Website des Verlags:
  • http://www.clcbio.com
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X 10.0 or later
  • Dateigröße:
  • 373 KB

Annotieren Sie die Reihenfolge mit GFF Stichworte


Annotieren Sie die Reihenfolge mit GFF Beschreibung

Annotate-Sequenz mit GFF ist ein Plug-In, mit dem Sie eine Sequenz mit Anmerkungen aus einer GFF-Datei (generisches Funktionsformat) in CLC Workbench oder CLC Server annotieren können. Eine GFF-Datei enthält keine Sequenzinformationen, es enthält nur eine Liste von Anmerkungen. Weitere Informationen zum Format finden Sie unter http://www.sanger.ac.uk/software/formats/gff. Sie können auch GTF-Dateien (GEN-Übertragungsformat) verwenden. Dieses Format wird von anderen den UCSC-Genombrowser unter http://genome.ucsc.edu verwendet. Wenn Sie einen Anmerkungsspur herunterladen (z. B. SNPs, Wiederholungen), können Sie dies als GTF-Datei erhalten.note! GTF-Dateien, die vom UCSC-Genom-Browser heruntergeladen wurden, sind nicht mit der RNA-SEQ-Analyse der CLC-Genomics Workbench nicht kompatibel, da die Gen- und Transkript-Anmerkungen nicht übereinstimmen können. NUR: Die Annotat-Sequenz mit GFF-Software dient nur für Forschungszwecke.


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