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NMR-Relax ist für die Untersuchung der Dynamik von Proteinen oder anderen Makromolekülen konzipiert. NMR-Relax ist für die Untersuchung der Dynamik von Proteinen oder anderen Makromolekülen konzipiert, wobei die Analyse der NMR-Relaxationsdaten analysiert. Es ist ein Gemeinschaftsprojekt, das von NMR-Spektroskopisten für NMR-Spektroskopisten erstellt wurde. Es unterstützt die Exponentialkurve, die zur Berechnung der R1- und R2-Relaxationsraten, die Berechnung der NOE, der reduzierten Spektraldichte-Mapping und der Lipari- und Szabo-Modell-freien Analyse unterstützt. Hier sind einige wichtige Funktionen von "nmr-relax": · Unterstützte NMR-Theorien Die folgenden Relaxationsdatenanalyse-Techniken werden derzeit von entspannt unterstützt: · Modellfreie Analyse (Lipari und Szabo, 1982a; Lipari und Szabo, 1982b; Clore et al., 1990) · Reduzierte Spektraldichte-Mapping (Farrow et al., 1995, Lefevre et al., 1996) · Exponentielle Kurvenmontage (um die R1- und R2-Relaxationsraten zu finden) · Steady-Cair-Noe-Berechnung · Datenanalysewerkzeuge Die folgenden Werkzeuge werden als modulare Komponenten implementiert, die von einer beliebigen Datenanalyse-Technik verwendet werden sollen: · Zahlreiche hochpräzise Optimierungsalgorithmen · Modellauswahl (d'Auvergne und Gooley, 2003) · Akaike-Informationskriterien (AIC) · Kleiner Probengröße korrigiert AIC (AICC) · Bayesian- oder Schwarz-Informationskriterien (BIC) · Bootstrap-Modellauswahl · Single-Out-Kreuzvalidierung (CV) · Hypothese Testing Anova-Modellauswahl (nur die modellfreie spezifische Technik von Mandel et al., 1995 wird unterstützt) · Monte Carlo-Simulationen (Fehleranalyse für alle Datenanalyse-Techniken) · Modellbeseitigung - das Entfernen von fehlgeschlagenen Modellen vor der Modellauswahl (d'auvergne und dooly, 2006) Anforderungen: · Python Was ist neu in dieser Version: · Dies ist ein sehr kleiner Bugfix-Version, der Probleme mit der Benutzerfunktion von value.write () und mit der Fehleranalyse löst, wenn Sie eine Entspannungskurve ausführen.

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