Taverna A Distributed Compute Workflow-Komponenten in Java
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Taverna Ranking & Zusammenfassung

Taverna Stichworte

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Taverna Beschreibung

Eine verteilte Berechnung-Workflow-Komponenten in Java Taverna ist eine Sammlung von Workflow-Anlagen- und Beschreibungkomponenten, einschließlich einer hohen Sprache für Workflows namens Scufl (einfache konzeptionelle einheitliche Strömungssprache), ein reines Java-Objektmodell, ein PARSER, um das Modell aufzufüllen, und ein Satz von Ansichten und Controllern (einschließlich einiger Schwingkomponenten, um in Ihre Workflow-fähigen Anwendungen einzugeben). Um Workflows tatsächlich auszuführen, benötigen Sie auch die MyGrid-Workflow-Datenmodelle. TAVERNA-Kerndatenmodelle umfassen die Objektdarstellungen des Workflows selbst, alle Entitäten innerhalb des Workflows (Prozessoren, Ports, Datenverbindungen usw.) und das Modell für die fließenden Datenwerte Entlang der Datenverbindungen während einer Workflow-Anlage Es sind diese Aufgaben, die die Logik enthalten, die zum Kontaktieren von Webdiensten erforderlich sind, lokale Java-Klassen ausführen und die anderen mit ihren Prozessor-Entitäten verknüpften Aktionen ausführen.Instanzen der Task-Erweiterungen werden erstellt, wenn ein Workflow- und zugehörige Eingabeobjekte über die Workflow-Einreichungsschnittstelle übermittelt werden . Diese Schnittstelle kann ein in Prozess-Java-Verfahrensanruf sein oder in einem bestimmten Transport, z. B. Seife, in einem Remote-Service-basierten Einsatzmotor aufgerufen werden. FreeLuo ist in beiden Modi fähig, die Taverna Workbench beinhaltet eine Instanz des FreeLuo-Enactors, um Benutzer ohne einen zentralen WORKFLOW-Engine-Server mit grundlegenden Ersatzdiensten bereitzustellen. Die grafischen Benutzeroberflächenklassen sitzen auf einem Client-Computer und ermöglichen die Interaktion mit den Kerndaten Modellklassen sowie mit laufenden Workflow-Instanzobjekten in einem Anteilsmotor. Auf diese Weise können Workflow-Konstruktionen, Bearbeitung und Visualisierung sowie das Ersatz von ENACTOR-Management und Daten in den Ergebnissen und Zwischenwerten innerhalb einer Workflow-Instanz durchführen. Die Speicheroberfläche ist ein steckbarer Rahmen, der externe Daten- und Metadatenspeicher ermöglicht, Ereignisse innerhalb des Workflow-Ersatzdienstes zu beobachten Sammlungsinformationen zu diesen Ereignissen. Dies könnte ein Provenance-Collection-Plugin enthalten, das die Workflow-Erstellung beobachtet und Metadaten dabei in RDF-Formular aufzeichnet, oder ein Speicher-Plugin, das sich auf eine Relationsdatenbank zurückstreht, möglicherweise eine Lebenswissenschaftskennung (LSID), da die Erstellung ausgeführt wird. Die LSID-Autoritätsschnittstelle ist ein lesender Zugriffspunkt auf Daten, die in einem Datenspeicher gespeichert sind, und kann möglicherweise von den TAVERNA-Grafik-Benutzeroberflächenkomponenten verwendet werden, um die Ergebnisse früherer Workflows abzurufen und sie als Eingaben an aufeinanderfolgende Eingaben zu verwenden. Anforderungen: · Java 2 Standard Edition Runtime-Umgebung Was ist neu in dieser Version: Insekt: · - Abrufen von Ergebnissen unvorhersehbar · - SVG Renderer funktioniert nicht · - Registerkarte "Metadaten" für Eingabe- / Ausgabehäfen verwirrend · - Fehlerende Workflows gehen auf leere Ergebnisse · - Säule 'Ding' zu kurz in Logbuch-Datenbankschema · - T2-Anlassfehler mit Pauls-Workflow · - T2-Eingangsdialog öffnet sich nach einem Fehler nicht · - Workflow-Scavenger-Drop-Ports und Skriptinhalte für Rshell · - Vermeiden Sie Raven / MAVEN-Abhängigkeit von Remote Execution Service · - Remote-Ausführungsdienst mit veraltetem Taverna-Profil · - Testjavaprozess fehlgeschlagen während MAVEN Build · - T2-Validation fehlschlägt für Prozessoren, die zusammengeführte Ports enthalten. · - T2 FileDatamanager und FileBlobstore verwendet Datei.mkdirs, die nicht fadensicher ist · - Goviz ist nicht da · - Dokumentation ist veraltet · - JTIDYWorkertest schlägt aufgrund von Zeichensatzannahmen fehl Verbesserung: · - Die Ausführungsversion des Workflows sollte mit der Bearbeitungsversion entsprechen. · - Verschachtelte Workflow-Standort · - Die getrennten Ausgänge fehlschlagen den Workflow · - Verbesserungen der Mac OS X-Plist-Dateien · - Hinzufügen Unbekannter Hostausnahme in PluginManager Neue Funktion: · - eingebetteter Browser in Taverna · - Serialise Bean zum Stream anstelle von Datei · - T2-Renderer Raffinesse: · - Verbesserter Workflow-Editor Hinzufügen verbesserter Drag & Drop-Fähigkeiten Aufgabe: · - Erlauben Sie mehrere Implementierungen der Monitorschnittstelle

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