Single Marker Association. Single Marker Association ist ein einfaches Werkzeug, das den einzelnen Marker-Association zwischen einzelnen SNP-Markern berechnet.
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Single Marker Association. Ranking & Zusammenfassung

Single Marker Association. Stichworte

Marker Verband SNP Marker Association. SNP-Marker Kontrolldichotomie

Single Marker Association. Beschreibung

Single Marker Association ist ein einfaches Werkzeug, das den einzelnen Marker-Association zwischen einzelnen SNP-Markern berechnet. Single Marker Association ist ein einfaches Werkzeug, das den einzelnen Marker-Association zwischen einzelnen SNP-Markierungen und einem Case / Control-Dichotomy.Deage berechnet: Das Tool liest zwei Dateien als Eingabe, der erste ist ein Satz von Fall und der zweite Fall von Steuerungshaplotypen. Das Format der Dateien ist eine Zeile pro Haplotyp, bei der die SNP-Daten als 0 oder 1 dargestellt werden, getrennt durch Weißfläche. · Das Tool gibt eine Liste von Statistiken für jede Markierung · die Markierungsnummer (von links nach rechts in den Eingabedaten) · Die Frequenz des 0-Allele für die Fälle · Die CHI-Square-Kontingententabellenstatistik für den Marker · The CDF Von den Chi-Square-Statistiken · Der P-Wert der Statistik (1-CDF) Installation: Das SMA-Tool ist in C ++ geschrieben. Es sollte auf jedem UNIX-System kompilieren. Laden Sie den Quellcode herunter, laden Sie den Quellcode herunter und entpacken Sie ihn (TAR XZF SMA-V.TAR.GZ, wobei v die Versionsnummer von SMA ist), und führen Sie dann in der unter dem Auspacken erstellten Unterverzeichnis SMA-V aus. Was neu in dieser Version neu ist. · Unterstützung für (unphassierte) Genotyp-Daten.

Single Marker Association. Zugehörige Software