Simupop Time-Time-Populations-Genetik-Simulationsumgebung
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Simupop Ranking & Zusammenfassung

Simupop Stichworte

Python-Bibliothek Simulation Population Populationsgenetik Bevölkerungssimulation Genetik

Simupop Beschreibung

VORTEILE-TIME-PROPARE-Genetik-Simulationsumgebung SIMUPOP ist ein in Python geschriebenes Simulationsmodul für das in Python geschriebene Simulationsmodul. Der Kern von SIMUPOP ist eine Skriptsprache (Python), die eine große Anzahl von Objekten und Funktionen bereitstellt, um die Bevölkerung zu manipulieren, und einen Mechanismus, um Populationen in der Zeit weiterzuentwickeln. Mit dieser R / SPLUS-ähnlichen Umgebung können Benutzer erstellen, manipulieren und sich entwickeln Populationen interaktiv, oder schreiben Sie ein Skript und führen Sie ihn als Batchdatei aus. Aufgrund des flexiblen und erweiterbaren Designs kann SIMUPOP große und komplexe Evolutionsprozesse mit Leichtigkeit simulieren. Ein benutzerfreundlicheres Niveau bietet SIMUPOP eine zunehmende Anzahl von integrierten Skripts, die Simulationen durchführen, die von der Implementierung von Genetik-Modellen der Grundbevölkerung übertragen Datensätze unter komplexen evolutionären Szenarien. Anforderungen: · Python Was ist neu in dieser Version: · Bug: Fixieren Sie einen Fehler mit der Bevölkerung :: Removeloci, wenn der Pease Loci nicht in Ordnung ist. · Neu: Verhindern Sie die Verwendung von mehr als einer Wahrscheinlichkeit in Bernulli-Wegen. · Neu: Fügen Sie eine Tkinter-Implementierung für Simuprogress hinzu. · Bug: Fixieren Sie einen Fehler, in dem Subpopulation Namen der zusammengeführten Bevölkerung nicht ordnungsgemäß zusammengeführt werden. · Neu: Erlauben Sie die Angabe von Nicht-String-Werten in 'ChooseFrom' und 'SelectOneof' in Simuopt-Parameterspezifikation. · NEU: Erlauben Sie den Bedienern, an eine Python-Funktion auszugeben. · Neu: Erlauben Sie die Verwendung von Doppelklicken, um ein Durchsuchen-Dialogfeld für die Datei- und Verzeichniseingabe in Simuopt zu öffnen. · Fehler: Fixieren Sie einen Speicher-Leck-Fehler, der sich auf InfoEVAL und InfoExec bezieht. Optimieren Sie infoExec für einige einfache Anweisungen. · CHG: Ändern Sie den Parameter-FormularoffGenotype von PYOperator in den IsTransmitter als Ergebnis von Merging-Concepts 'Primary während des MATTER-Operators' und 'Genotyps-Sender'. · CHG: Verschieben Sie alle Skripts unter dem Verzeichnis Skripts in Online-Kochbuch. · CHG: Änderungsberechnungsberechnungen im Betreiberstat ändern. · NEU: Berechnung des HWE-P-Werts zum Stat-Bediener hinzufügen. · Neu: Test individueller Index in Bevölkerung :: RemoveIndividual · Fehler: Fixieren Sie einen Fehler, wenn in SplitSubPOPs keine Subpopulation angegeben ist. · CHG: MERGE STAT (Association) zu STAT (LD), zur Vorbereitung auf die Fallsteuerungstests. · NEU: (experimentell) Hülle / Kontrollverband CHISQ-Test für Status hinzufügen. · NEU: (experimentell) Fügen Sie den PI-Statistiken von Tajima (mittlerer paarweisedifferenz) dem Status von STAT () hinzu.

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