Pybpn Identifizieren Sie signifikante Verbindungen zwischen biologischen Prozessen unter Verwendung von Gen-Interaktionsnetzen
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Pybpn Ranking & Zusammenfassung

Pybpn Stichworte

Verbindungen biologisch

Pybpn Beschreibung

PYBPN ist ein Python-Modul, das Programme bereitstellt, um Verbindungen zwischen biologischen Prozessen (bezeichnete "Links") auf der Grundlage von Gen-Interaktion, Expressions- und Annotationsdaten zu erkennen. Eine Sammlung bedeutender Verbindungen und die teilnehmenden Prozesse bildet ein biologisches Prozessnetzwerk, oder bpn.pybpn stellt drei zugehörige Programme zum Finden von BPNs bereit, wobei jeweils verschiedene Ziele gefunden werden: BPLN bestimmt, ob Prozesse im Allgemeinen verbunden sind. Eine Umsetzung des von Dotan-Cohen et al. beschriebenen Algorithmus .cbpn bestimmt, ob bei einem bestimmten Vergleich von Bedingungen Verbindungen zwischen den Prozessen störenweise stört; eine Implementierung des von Lasher et al. beschriebenen Algorithmus .mcmcbpn ähnlich der CBPN, versucht jedoch, die kleinsten Reihe von Verbindungen zu entdecken, die so viel von der Störung der interagierenden Gene wie möglich beschrieben.

Pybpn Zugehörige Software