Offenes Babel Ein plattformübergreifendes Chemieprogramm und Bibliothek, die zum Konvertieren von Dateiformaten konzipiert werden
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Offenes Babel Ranking & Zusammenfassung

Offenes Babel Stichworte

Bücherei Chemie Chemieprogramm Chemiebibliothek Molekulare Modellierung. Interconvert

Offenes Babel Beschreibung

Ein plattformübergreifendes Chemieprogramm und Bibliothek, um Dateiformate zu konvertieren Das Öffnen von Babel-Projekt ist so konzipiert, dass Babel aufgehoben wird, wenn Babel aufgehört wird, als plattformübergreifendes Programm und Bibliothek, die zwischen vielen Dateiformaten, die in der molekularen Modellierung und der Computational Chemie verwendet werden, interkonvertieren. Hier sind einige wichtige Funktionen von "Open Babel": · Eine große Auswahl an allgemeinen chemischen Dateiformaten, einschließlich SDF / Mol, Mol2, PDB, Lächeln, XYZ, CML ... (Details) · Anerkennung des Dateityps basierend auf der Dateinamenerweiterung · Chemische MIME-Unterstützung · Smarts Matcher. · Flexibles Atom Typer · Flexible Bond Typer zur Wahrnehmung mehrerer Bindungen aus Atomkoordinaten · Gasteiger-Teilladungsberechnung · Addition und Löschung von Wasserstoff · Isotop-Unterstützung, Berechnung der durchschnittlichen und genauen Massen · Automatische Funktionswahrnehmung (Ringe, Bindungen, Hybridisierung, Aromatizität) · Mehrfachkonformer Speicher in Molekülen · Befehlszeilenumwandlung für mehrere Moleküle in einer Datei · Befehlszeilenschnittstelle · Bitvector-Klasse. · Vektor- und Matrixtransformationen · Molekulare Testsuite · Open-Source / Free-Software unter der GNU General Public License · Cross-Plattform (Windows, Linux, Mac OS X, SGI, Solaris, Dreamcast ...) Was ist neu in dieser Version: · Diese Version stellt eine große Fehlerbehebung dar und ist ein stabiles Upgrade, das für alle Benutzer von Open BABEL stark empfohlen wird. Während es möglicherweise nicht viele neue Funktionen gibt, wurden seit 2.2.1 viele Abstürze und andere Fehler behoben. · Aufgerüstet auf die neue Inchi 1.02-Version, um ein standardisierter Inchi- und Inchikeny-Ausgang zu erzeugen. · Haben Sie viele Stereochemie-Fehler behoben, wenn Sie lächeln / schreiben. Dies ist Teil eines größeren Projekts, das in der 2.3-Version abgeschlossen ist. · Feste Zusammenstellung und Installation auf Cygwin- und Mingw-Plattformen. · Deutlich verbesserte Aromatizität und Kekule-Bindungszuordnung. · Verbesserte 2D -> 3D-Koordinatengenerierung · Verbesserte Koordinatenerzeugung mit dem Befehlszeilenbetrieb von --gen3d · Verbesserte Leistung für die Koordinatengenerierung. · New-Filluc-Befehlszeilenoperation für BABEL. · Fixiert an pH-abhängige Wasserstoffzugabe. · Unterstützung für das Lesen von Vibrationsdaten von Molden, MOLPRO und NWCHEM-Ausgabedateien hinzugefügt. · Atomic Radii aus den jüngsten theoretischen Berechnungen aktualisiert. · Fehler beim Lesen von GZIP-komprimierten MOL2- oder XML-Dateien behoben. · Schließen Sie Dateien nach einem Fehler. Behebt einen Fehler mit Pybel, wo Dateien offen bleiben würden. Viel mehr Fehlerbehebungen und kleine Merkmalsverbesserungen. == Neue Dateiformate == Import und Export: · MOLPRO-Eingang und -AUSPUT. · VEP-Koordinatendateien (Contcar und Poscar).

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