Obtools Skripts und Bibliothek für die biologische Sequenzanalyse
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Python-Bibliothek Analysator Reihenfolge biologisch biologische Sequenzanalyse

Obtools Beschreibung

Skripts und Bibliothek für die biologische Sequenzanalyse ObiTools ist ein Satz von Python-Skripts, die erstellt werden, um die Manipulation von Sequenzdateien in unseren Labors zu vereinfachen. Sie erhielten hauptsächlich Design, um uns während der Analyse der Sequenzerausgänge der nächsten Generation (454 oder Solexa) zu helfen. Diese Skripts setzt auf einer Python-Bibliothek mit demselben Namen "ObiTools''the library" und die mit unseren Bedürfnissen entwickelten Skripts. Sie bieten hauptsächlich Anlagen, um Sequenzdateien im FASTA-Format zu manipulieren. Andere Formate werden als Genbank oder EMBL unterstützt. Die "ScriptHhe ObiTools" -Scripts "ScriptHhe ObiTools" soll Ihnen dabei helfen, verschiedene Daten- und Sequenzdateien in bequemer Weise mit der UNIX-Befehlszeilenschnittstelle zu manipulieren. Sie folgen der Standard-UNIX-Schnittstelle für das Befehlszeilenprogramm, wodurch ein Satz von Skripts mit dem Rohrmechanismus ketten kann. Alles Diese Skripts haben einen A-H-Option, der eine kleine Online-Hilfe druckt, um die von dem Skript akzeptierten Optionen zu beschreiben. Wenn eine Option akzeptiert wird. Diese Option wird von mehreren Skripts freigegeben, diese Option wird von demselben Buchstaben in all diesen Skripts benannt. Dies geschieht, um die Verwendung von Obitools-Skripts zu erleichtern. Auf gleicher Weise beginnt sich der Name eines Skripts mit einem Präfix, das das Format der Eingabedatei angibt, das das Format der Eingabedatei angibt. Die '' '' 'OBItools' 'Python LibraryObBitools ist ein Satz von Skripts, aber auch eine Python-Bibliothek. Sie können diese Bibliothek frei verwenden, um Ihre eigenen Skripts zu erstellen. Anforderungen: · Python

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