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MassSpec :: ViewSpectrum :: Realvshyppeptid ist ein Perl-Modul, um ein echtes Massenspektrum in derselben Grafik anzuzeigen. MassSpec :: ViewSpecTrum :: Realvshyppeptid ist ein Perl-Modul, um ein echtes Massenspektrum auf demselben Graphen als hypothetisches Spektrum anzuzeigen, das durch Fragmentierung eines Peptids in silico.synopsis erzeugt wird, verwenden MassSpec :: ViewSpecTrum :: Realvshyppeptid; Grafik öffnen, "> mygraphic.png" oder sterben Sie "Ausgabedateien nicht möglich"; BinMode-Grafik; Mein @masses = (78.1.81.1.81.7.85.4.86.8,88,88,89,4,99.8.99.8.89.4.88.8.19.19.19.4.4.11.11.112.1.129.1, 130.11.132.1.147.11.157.11.158.11.159.11.159.11.158.11.159.11.159.1171.1171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171.171] , 229.1.246.2.258.1, 266.0327.2.328.2.345.2415.2426.2.345.2.2.531.2.559,3.2.53.2.559,3,623,3,39,3,3,3,3,3,39,3,3,343,3,004,4, 645,0,647,5,686,4,687,4.689,4); meine @intensitäten = (8.7,7,7,7,3,10,5,7,7,7,3,8,4,8,0,9.1,1,7,3,28,0, 12,1,7,2,28,0, 12,1,7,3,8,0, 7,7,11,9,9,9), 7,7,1,1,9,9.8.10.1,1,1,1,00,5,13,1,1,1,1,1 km) 50.3.22.7,44,7,16,8,30.4,18,2,53,25,5, 15,7,7,2,14,046,8,38,4,3,3,1,1,38,4,3,1,1,1,5,8,7,3,8,00,8,7,7,7,3,8,7,3,2,00,8,18,7,3,38,8); mein $ peptid = "rtsvar"; My $ vs = MassSpec :: ViewSpectrum :: REALVSHYPPEPTID-> NEU ($ Peptid, @ Massen, @ Intensitäten); $ vs-> Set (Yaxismultiplier => 1.8); # A Sample Tweak, um den Ausgang $ vs-> Set anzupassen (Titel => "BSA-689 -". $ Peptid); meine $ output = $ vs-> plot (); drucken graphic $ output; Schließen Sie Grafik; MassSpec :: ViewSpectrum :: REALVSHYPPEPTID - Sehen Sie ein echtes Massenspektrum auf demselben Graphen als hypothetisches Spektrum, das durch Fragmentieren eines Peptids in Silico erzeugt wird. Die in Silico-Fragmentierung wird durchgeführt, indem alle möglichen Peptide erzeugt werden, die entweder den Amino-terminalen oder carboxyl-terminalen Aminosäuren enthalten.Negative Peakintensitätswerte sind zulässig; Dies ermöglicht die Zeichnung von "Pseudospectra", das beispielsweise in einem Spektrum vorhandene Peaks veranschaulicht, aber in einem anderen fehlen. Beachten Sie, dass diese negativen Peaks keine echten Intensitäten haben, aber in einigen Fällen weisen wir in einigen Fällen verschiedene Höhen auf, um die Unterschiede zwischen verschiedenen hypothetischen Gipfeln zu veranschaulichen. Darüber hinaus wird die Pseudocoloring von positiven und negativen Peaks durchgeführt, um zu veranschaulichen, welche Art von Ion, die Peak darstellt, darstellt. In einigen Fällen sind diese Ionen explizit gekennzeichnet, obwohl es in der Praxis am besten ist, diese Kennzeichnung zu minimieren, um übermäßiges Durcheinander zu vermeiden. Anforderungen: · Perl.

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