Kain stochastische Simulationen für chemische Kinetik
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Kain Ranking & Zusammenfassung

Kain Stichworte

Chemie stochastisch chemische Reaktionen stochastische Simulationen deterministisch

Kain Beschreibung

Stochastische Simulationen für chemische Kinetik Kain kann stochastische und deterministische Simulationen verschiedener chemischer Reaktionen durchführen. Es kann mehrere Simulationsprozesse spawn, um Multi-Core-Computer zu verwenden. Es speichert Modelle, Simulationsparameter und Simulationsergebnisse in einem XML-Format. Darüber hinaus können SBML-Modelle importiert und exportiert werden. Die Modelle und Simulationsparameter können aus Eingabedateien gelesen oder im Programm bearbeitet werden. Die GUI (Grafische Benutzeroberfläche) ist in Python geschrieben und verwendet das WXPYTHON-Toolkit. Die Löser werden als ausführbare Befehlszeile implementiert, die in C ++ geschrieben wurden, die von Kain angetrieben werden. Dies macht es einfach, Batch-Jobs zu starten. Es vereinfacht auch den Prozess des Hinzufügens neuer Löser. Kain bietet eine Vielzahl von Löser an: - Gillespie's Direct-Methode.- Gillespies erste Reaktionsmethode.- Gibson und Brucks nächste Reaktionsmethode.- Tau-springen.- Hybrid-Direct / Tau-springen.- ODE-Integration. Was ist neu in dieser Version: · Verbesserte Dokumentation. · Einfache Löser für zeitweilweise inhomogene Probleme. · Histogramm-Löser, die jetzt den Mittelwert und die Varianz aufzeichnen. · Verbesserte Jobplanung. · Verbesserte Dateiformate. · Refactoring, um der zukünftigen Entwicklung zu helfen.

Kain Zugehörige Software