Grundlegendes lokales Alignment-Suchwerkzeug Eine Reihe von Ähnlichkeitssuchprogrammen.
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Grundlegendes lokales Alignment-Suchwerkzeug Ranking & Zusammenfassung

Grundlegendes lokales Alignment-Suchwerkzeug Stichworte

Ausrichtung Basic lokal Ausrichtungssuche. heuristischer Algorithmus Regionen finden.

Grundlegendes lokales Alignment-Suchwerkzeug Beschreibung

Eine Reihe von Ähnlichkeitssuchprogrammen. Das grundlegende lokale Alignment-Suchwerkzeug ist in Short Blast ist ein Satz ähnlicher Suchprogramme, um alle verfügbaren Sequenzdatenbanken zu erkunden, unabhängig davon, ob die Abfrage Protein oder DNA ist. Es ist daher in der Lage, Beziehungen zwischen den Sequenzen zu erkennen, die nur isolierte Ähnlichkeitsregionen teilen.Es können lokal als vollständige ausführbare Ausführung ausgeführt werden und können verwendet werden, um BLAST-Suchen mit privaten, lokalen Datenbanken oder heruntergeladenen Kopien der NCBI-Datenbanken auszuführen. Es läuft auf Mac OS, Win32, Linux, Solaris, IBM Aix, SGI, Compaq OSF und HP-UX-Systemen. Was ist neu in dieser Version: · Die BLASTDB-Umgebungsvariable unterstützt nun mehrere Datenbanksuchpfade. Wenn möglich, wird eine kleinere Protein-Nachschlagetabelle zur Verbesserung der Leistung verwendet. · FormatRPSDB unterstützt jetzt das Erstellen von Datenbanken, die größer als 2G sind. · SeedTop unterstützt jetzt Suchanfragen mit GI-Listen. · Der X3-Wert für Blastn / Megablast wurde korrigiert.

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