Gabedit. GUI für Gaußsche und Molpro.
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Gabedit. Stichworte

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Gabedit. Beschreibung

GUI für Gaußsche und Molpro. GABEDIT ist eine grafische Benutzeroberfläche zu Gaußschen, Molcas-, MOLPRO- und MPQC-Computational Chemistry-Paketen. GABEDIT enthält grafische Einrichtungen zum Erzeugen von Keywords und Optionen, Molekül-Spezifikationen und deren Eingangsabschnitte für selbst den fortschrittlichsten Berechnungsarten GABEDIT beinhaltet einen fortschrittlichen Molekül-Builder. Sie können es verwenden, um in Molekülen schnell zu skizzieren und in drei Dimensionen zu untersuchen. Sie können Moleküle von Atom, Ring, Gruppen, Aminosäure und Nukleosid bauen. Sie können auch Geometrie aus einer Datei lesen. Die meisten wichtigen molekularen Dateiformate werden unterstützt. GABEDIT enthält ein Gaußsche, Molcas-, MOLPRO- und MPQC-Berechnung-Setup-Fenster, mit dem Sie auf einfache und unkomplizierte Weise Gaußsche, Molcas-, MOLPRO- und MPQC-Jobs einrichten können. GABEDIT enthält einen Texteditor für die Bearbeitung von Molcas-, MOLPRO-, Gaußschen und MPQC-Eingabedateien. GABEDIT kann eine Vielzahl von Gaußschen, Molcas-, MOLPRO-, MPQC- und (teilweise) ADF-Berechnungsergebnissen grafisch anzeigen, einschließlich der folgenden: · molekulare Orbitale. · Oberflächen von der Elektronendichte, elektrostatischen Potential, NMR-Abschirmdichte und anderen Eigenschaften. · Oberflächen können in festen, durchscheinenden und Drahtnetzmodi angezeigt werden. · Oberflächen können von einer separaten Eigenschaft gefärbt werden. · Konturen (colorcoded). · Flugzeuge (colorcoded). · Dipol · XYZ-Achsen und die Hauptachsen des Moleküls. · Animation der normalen Modi, die Schwingungsfrequenzen entsprechen. · Animation der Drehung von Geometrie, Oberfläche, Dipol, XYZ und den Hauptachsen des Moleküls. · Animation von Konturen. · Animation von kolorierten Flugzeugen. GABEDIT kann IR- und Raman-Computer-Spektren anzeigen. GABEDIT kann eine POVRAY-Datei für Geometrie erzeugen (Atome + Bindungen, einschließlich Wasserstoffbindung), Oberflächen (einschließlich farbmodischer Oberflächen), Konturen, kolorierten Ebenen. GABEDIT kann das Bild in einem PPM-, BMP-, (JPEG-) und PS-Format speichern. GABEDIT kann automatisch eine Reihe von Bildern für Animationen generieren (Vibration, Geometriekonvergenz, Rotation, Konturen, Colorcoded-Flugzeuge) Anforderungen: · GTK +. Was ist neu in dieser Version: · Kleinere Fehler wurden behoben · Alle geometrischen Änderungen können mit dem Rückgängig- und Redo (U / U oder CTRL z / ctrl y) rückgängig gemacht und erneut umgewandelt werden. · Der Benutzer hat die vollständige Kontrolle über die in einer Zeichnung angezeigten Anleihen. · Die Zeichnung des Molekülatoms durch Atom wurde vereinfacht. · Die Zeichnung des Moleküls Fragment durch Fragment wurde vereinfacht. · GABEDIT Lesen Sie Verbindungen aus GABEDIT, Hin, PDB, MOL2- und MOL-Dateien. · Der Benutzer kann den Wert der Entfernung, den Bindungswinkel und den den dialedralen Winkel einstellen. · Eine molekulare Dynamik-Konformationssuche wird unter Verwendung eines MM-Potentials (Amber 99) implementiert. · Eine molekulare Dynamik-Konformationssuche wird unter Verwendung einer semi-empirischen Methode (von offenem MOPAC oder PCGamess) implementiert. · Migration von GDK-Zeichnungsfunktionen an Kairo: Rendern des Kreuzes für Vektorgrafiken. · Kairo wird jetzt für das XYPLOT GABEDIT-Widget (von GABEDIT für Zeichnungsspektrum verwendet) verwendet. · Cairo wird jetzt für das Geometrie-Zeichnungsfenster verwendet. · Geometrie kann in EPS, PS, PDF oder SVG-Datei exportiert werden. · Die Kurven des XYPLOT-Fensters können in EPS, PS, PDF oder SVG-Datei exportiert werden. · Neues Werkzeug für den Rechenabstand zwischen 2 Punkten auf dem XYPLOT-Fenster. "Control + Shift-Taste" kann für ein Zoom auf dem XYPLOT-Fenster verwendet werden. · Die neue Version von PCGamess (Firefly) wird jetzt unterstützt

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