GO :: Modell :: Term

GO :: Modell :: Term ist ein Begriff oder ein Konzept in einer Ontologie.
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GO :: Modell :: Term Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Perl Artistic License
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • GO::Model::Term Team
  • Website des Verlags:
  • http://search.cpan.org/~cmungall/go-perl-0.04/GO/Model/Term.pm

GO :: Modell :: Term Stichworte


GO :: Modell :: Term Beschreibung

GO :: Modell :: Der Begriff ist ein Begriff oder ein Konzept in einer Ontologie. GO :: Modell :: Term ist ein Begriff oder ein Konzept in einer Ontologie.synopsis # aus einer Datei Verwendung GO :: PARSER; Mein $ PARSER = NEUE GO :: PARSER ({Handler => 'obj'}); # Erstellen von Parser-Objekt $ Parser-> Analyse ("Gen_ontology.obo"); # Parse-Datei -> Objekte My $ Graph = $ Parser-> Handler-> Graph; # Holen Sie sich ein Objekt mein $ Term = $ graph-> get_term ("GO: 0001303"); # Abrufen eines Begriffs nach ID printf "Term% s% Sn", $ Term-> Name, $ SMS-> ACC; # Aus einer Go-Datenbank (erfordert GO-DB-Perl) MY APPH = GO :: Apphandle-> Connect (-DBName => $ dbname); mein $ term = $ apph-> get_term ({acc => 00003677}); Printf "Term:% s (% s) NDefinition:% Snsynonyme:% SN", $ Term-> Name, $ Term-> Public_acc, $ Term-> Definition, Join (",", @ {$ term-> synonym_list }); Stellt einen ontologischen Begriff dar; Die gleiche Klasse wird für Prozess-, Fach- und Funktionsstörungen verwendet, ein Begriff ist sich der Beziehungen nicht bewusst; Um herauszufinden, wie ein Begriff mit anderen Bedingungen zusammenhängt, verwenden Sie das A Go :: Modell :: Graph-Objekt, das Ihnen das GO :: Modell :: Relationship-Objekte gibt; Beispiele $ rels = $ graph-> get_parent_relationships ($ term-> acc); Anforderungen: · Perl.


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