Epos

Schätzung der Phyogene der Arten.
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Epos Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • LGPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Thasso Griebel
  • Website des Verlags:
  • http://www.bio.informatik.uni-jena.de/epos/

Epos Stichworte


Epos Beschreibung

Schätzung der Phyogene der Arten. EPOS ist ein modularer Software-Framework für phylogenetische Analysen und Visualisierung. Die vorhandene phylogenetische Software kann in zwei Gruppen aufgeteilt werden. Algorithmische Pakete, die Rechenmethoden für ein bestimmtes Problem und Visualisierungswerkzeuge zur Analyse von Ergebnissen bereitstellen. Viele algorithmische Werkzeuge fehlen in der Benutzerfreundlichkeit, da sie häufig eine Befehlszeile basieren, während die Visualisierungen häufig an schlechten grafischen Benutzeroberflächen leiden. Datenstrukturen. Eine konsistente Schnittstelle dient zur Verwaltung von Daten oder zum Starten der verfügbaren Rechenmethoden, wodurch der Arbeitsablauf von den Daten oder an der angewandten Methode getrennt wird Alle Methoden sind in ein Pipeline-System integriert, das Kombinationen von Methoden ermöglicht, die sequentiell ausgeführt werden, wobei der Datenfluss automatisch vom System behandelt wird. Eine umfassende Baumansicht ist in EPOs enthalten. Es bietet verschiedene Layouts, Colorization, Annotation und Exportfunktionen an und ist in der Lage, Bäume mit Bäumen bis zu einigen tausend Blättern zu rendern. An Visualisierungen sind Teil des modularen Systems, sie können in beliebiger Richtung erweitert werden, und neue Visualisierungsmodule können integriert werden, um zu handhaben , sagen, phylogenetische Netzwerke. Um die Datenabwicklung zu vereinfachen, ermöglicht das EPOs dem Benutzer, einen persistenten Arbeitsbereich zu erstellen, der alle verwendeten Datensätze enthält. Daten innerhalb des Arbeitsbereichs werden beharrlich in einem transparenten und ausziehbaren Backend-Modul gespeichert. Was ist neu in dieser Version: · Die Version enthält keine neuen Funktionen, behebt jedoch einige der beliebigsten Fehler, einschließlich der "Leerzeichen in Ihrem Installationspfad".


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