Brainatlas Eine Python-Schnittstelle zum Ratte Brain Atlas
Jetzt downloaden

Brainatlas Ranking & Zusammenfassung

Brainatlas Stichworte

Gehirn Python-Bibliothek Python Ratte

Brainatlas Beschreibung

Brainatlas ist ein Python-Modul mit dem folgenden Zweck: Mit dem Ratten-Brain Atlas ... 1) 3D-Punktwolken von verschiedenen Hirnregionen erstellen2) Nachschlagen des Bereichs für einen bestimmten Ort (ML, DV, AP-Koordinate) 3) Ergreifen Sie den mitgelassenen Abschnitt Bild für einen bestimmten Ort4) Plotten Sie einen Ort auf einer abgeflachten kortikalen Oberflächeninstallationsdetails, die in den Urheberrechtsgründen angezeigt werden, enthält dieses Modul keine EPS-Dateien von der CD, die mit dem RAT-Brain Atlas geliefert wird. Diese Dateien sind jedoch für das Modul erforderlich. Sie können entweder den Pfad der EPS-Dateien an die erforderlichen Funktionen (z. B. Abschnitt __ init__) übergeben oder die EPS-Dateien (von mindestens den koronalen Abschnitten) in Atlas / EPS kopieren .Wie den Abschnittsindex für den enthaltenden Abschnitt >>> pjatlas.py § 6,53.5 -7plot einen Ort in einem Abschnitt (zeigen und speichern Sie das Diagramm) >>> pjatlas.py § 6,53.5 -7 -PSGET den Bereich für a Standort >>> Pyatlas.py-Bereich 6.53.5 -7 GETRIBE Eine Punktwolke eines Bereichs (auf Meshes / .asc gespeichert) >>> pjatlas.py-Punkte V2L -MPLOT Ein Ort auf einem abgeflachten Kortex >>> pjatlas.py Cortex 6.53.5 -7-psseVerangehörige Anrufe an einer abgeflachten kortikalen Oberfläche werden viel schneller machen Area.pnotesthis ist Buggy und Hacky wie alle Heckwelhe, die ich wollte, war, ein 3D-Netz eines ausgewählten Gehirnbereichs aus einem Stapel von markierten Brain Atlas Imagessteps zu erzeugen: 1) Nehmen Sie EPS-Dateien eines Gehirnatlas2) f Indiel Standort eines ausgewählten Bereichs in jeder EPS-Datei3) Render EPS-Datei in Bitmap-Format4) Finden Sie Pixel, die dem Rand des ausgewählten Bereichs entsprechen5) Kartenbild auf Gehirnkoordinaten6) Ausgabe 3D-Brain-Koordinaten für den Rand des ausgewählten Bereichs bei jedem Slice7) Verwenden Sie Meshlab, um Mesh von PointSthis zu erzeugen, ist schrecklich Hacky und stützt sich auf: 3) Manuelles Netz mit Kugelschwenken in Meshlabwhat, das ich wirklich mögen würde, ist wirklich flexibler für alle Atlas-Slices3) Punkte Datei für einen Bereich (EX: v1.Ac) 2) Vereinfachen Sie die Punkte: Filter -> Reinigung -> Merge: ~ .05 World Units3) Speichern als Mesh (Ex :.ply) 4) Reload3) Mesh Die Punkte: Filter -> Remeshing -> Oberflächenrekruction (Ballverschwenken): ~ .5 Welteinheiten (oder 0,7 für V2L) 5) Schließen Sie Löcher5) glatt: Filter -> Glättung -> Laplace Smooth: 2 Iterationen6) Als Mesh (Ex :. PLY) Produkthomepage

Brainatlas Zugehörige Software