 | Biopy-Isatab.Python-Parser für Isatab |
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Biopy-Isatab. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- MIT/X Consortium Lic...
- Preis:
- FREE
- Name des Herausgebers:
- Brad Chapman
- Website des Verlags:
- https://github.com/chapmanb/
Biopy-Isatab. Stichworte
Biopy-Isatab. Beschreibung
BIOPY-ISATAB ist ein Python-Parser zum Extrahieren von Informationen aus iSa-Tab-formatierter Metadaten. Nutzung lautet: Von BCBIO Import ISATAB REC = ISATAB.PARSE (Isatab_Metadata_Directory) Der zurückgegebene Datensatz entspricht der allgemeinen Untersuchung / der Assay-Struktur von Isatab. Das Top-Level-Isatabrecord-Objekt enthält Informationen zur Untersuchung, zusammen mit Studieninformationen als isatabstudyrecord-Objekte. Jeder Datensatz hat Assay-Informationen in IsatabassAYRECORD-Sub-Objekten.Das Ausgang wird im Parser-Modul näher beschrieben: https: //github.com/sia-tools/biopy-isatab/blob/master/bcbio/isatab/parser.pyand Das Testverzeichnis enthält ein Beispiel für Nutzungs- und Informationsabsaugung: https: //github.com/sia-tools/biopy-isatab/blob/master/test/test_isatab.pyYou kann auch die Struktur eines Objekts anzeigen, indem Sie ihn drucken: >> > Drucken Isatab_Rec * Isatab Record Metadata: {} Studium: * Studieren Sie Metadaten: {'Studie Beschreibung': 'C2C12 Maus Skelettmuskelzellen', 'Studienkennung': 'SB-S-1', 'Study-Einreichungstermin': ' 2010-10-04 '} Knoten: * Knoten C2C12 Sample3 REP3 Sample Name Metadata: {' Sample Name ': ,' Organismus ': } Die Homepage des Produkts
Biopy-Isatab. Zugehörige Software
CAPTIONSTRANSFORMER.
A-Set von Tools (API + Skript), um Untertitel von / auf viele Formate zu lesen, schreiben und umzusetzen ...
