Bio :: gmod. BIO :: GMOD ist eine einheitliche API für Modellorganismatenbanken.
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Perl-Modul API Einheitlich Unified API. Modellorganismus Datenbanken

Bio :: gmod. Beschreibung

BIO :: GMOD ist eine einheitliche API für Modellorganismatenbanken. BIO :: GMOD ist eine einheitliche API für Modellorganismatenbanken (-mod => 'Wormbase'); Meine $ Version = $ mod-> live_version; Aktualisieren Sie eine Mod-Installation, verwenden Sie BIO :: GMOD :: Update; mein $ mod = bio :: gmod :: update-> neu (-mod => 'wormbase'); $ gmod-> update (); Abrufen einer Liste der Gene aus einem Mod verwenden BIO :: GMOD :: Abfrage; Meine $ mod = bio :: gmod :: abfrage-> neu (-mod => 'wormbase'); My @genes = $ mod-> fetch (-class => 'Gen', - Name => 'UNC-26'); BIO :: GMOD ist eine einheitliche API für den Zugriff auf verschiedene Modellorganism-Datenbanken. Es ist ein Teil des generischen Modells der Modellorganism-Datenbankprojekte sowie auf cpan.mods verteilt sind stark kurierte Ressourcen biologischer Daten. Obwohl sie typischerweise Sequenzdaten enthalten, die in Gemeinschafts-Repositories wie NCBI untergebracht sind, setzen sie diese Informationen in einem Rahmen der biologischen Fusions-Geland, die von der veröffentlichten Literatur der Experimente in Modellorganismen gelesen werden. Vermeiden Sie die große Verbreitung von MODS, die Data-Mining-Strategien von Cross-Site waren gewesen schwer umzusetzen. Solche Strategien erfordern typischerweise eine Vertrautheit mit dem zugrunde liegenden Datenmodell und dem historischen Vokabular des Modellsystems. Die schnell entwickelnde Natur dieser Projekte hat die Installation eines Mod lokal installiert und auf dem neuesten Stand eingeräumt Erfahrung verbraucht. Anforderungen: · Perl.

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