Bio :: db :: das :: chado Zugriff im DAS-Stil auf eine Chado-Datenbank
Jetzt downloaden

Bio :: db :: das :: chado Ranking & Zusammenfassung

Bio :: db :: das :: chado Stichworte

Datenbank Perl-Modul Perl Datenbankzugriff Chado-Datenbank Chado

Bio :: db :: das :: chado Beschreibung

DAS-STYLE-Zugang zu einer Chado-Datenbank Chado ist das GMOD-Datenbankschema, und Chado ist eine bestimmte Instanz davon. Es ist immer noch etwas von einem sich bewegenden Ziel, sodass dieses Paket wahrscheinlich mehrere Updates in den kommenden Monaten erfordern wird, um sie arbeiten zu lassen .Synopsis # öffnen Sie eine Feature-Datenbank $ db = bio :: db :: das :: chado-> neu (-dsn => 'dbi: pg: dbname = gadfly; host = lajolla' -user => 'jimbo', -pass => 'supersecret',); @segments = $ db-> Segment (-Name => '2l', -start => 1, -END => 1000000); # Segmente sind BIO :: DAS :: Segmenti - kompatible Objekte # Abrufen einer Liste der Funktionen @Features = $ db-> Funktionen (-Type => ); # Rufen Sie einen Rückruf über Funktionen $ dB-> Funktionen (-Type => , -callback => sub {...}); # Holen Sie sich alle Feature-Typen @Types = $ db-> -typen; # Grafypen% Typen = $ db-> Typen (-Enumerat => 1); @Feature = $ db-> get_feature_by_name ($ class => $ name); @Feature = $ db-> get_feature_by_target ($ target_name); @Feature = $ db-> get_feature_by_attribute ($ att1 => $ value1, $ att2 => $ value2); $ Feature = $ db-> get_feature_by_id ($ ID); $ error = $ db-> Fehler; Anforderungen: · Perl.

Bio :: db :: das :: chado Zugehörige Software