Bio :: Nexus :: Entfernungsperma BIO :: Nexus :: DistanceBlock ist ein Perl-Modul, das Entfernungsblock in der Nexus-Datei darstellt.
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Bio :: Nexus :: Entfernungsperma Beschreibung

BIO :: nexus :: distanceblock ist ein Perl-Modul, das Entfernungsblock in der Nexus-Datei darstellt. BIO :: Nexus :: DistanceBlock ist ein Perl-Modul, das Entfernungsblock in der Nexus-Datei darstellt. Die Entfernungsperma-Klasse stellt einen neuen Block mit Nexus-Distanzen dar. Entfernungen Blöcke enthalten Entfernungsmatrizen oder eine Tabelle der berechneten Entfernungen zwischen jedem möglichen Paar von Taxa.MethodsNew-Titel: Neue Verwendung: block_object = Neuer Bio :: nexus :: distanceblock ($ block_type, $ -Blugs, $ -Bose, $ Taxa); Funktion: Erstellt ein neues BIO :: NEXUS :: DistanceBlock-Objekt-Rückgabe: BIO :: NEXUS :: DistanceBlock-Objekt-Args: Typ (String), die Befehle / Kommentare zur Analyse (Array REF), und eine ausführliche Flag (0 oder 1) get_matrix Titel: Get_Matrix Verwendung: $ matrix = $ self-> get_matrix (); Funktion: ruft die gesamte Entfernungsmatrix zurück $ dist = $ matrix -> {$ col_taxon} {$ col_taxon} get_distance_for Titel: Get_Distance_Für Verwendung:% Taxon1_Distance =% {$ self-> get_distance_for ($ erster_taxon)}; Funktion: ruft eine Zeile der Entfernungsmatrix zurück Funktion: ruft eine Zelle aus der Matrixrendite ab: Ein Skalar (Nummer) Args: Die Zeilen- und Säulenetiketten (beide Taxa) für die gewünschte Zelle: Im Allgemeinen get_distance_between ($ a, $ b) == get_distance_between ($ b, $ a ); Dies muss jedoch nicht wahr sein, wenn die Distanzmatrix nicht symmetrisch ist. Stellen Sie sicher, dass Sie nach der von Ihnen gewünschten Entfernung fragen. Anforderungen: · Perl.

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