BIO :: db :: gff :: Feature BIO :: db :: gff :: Feature ist ein relatives Segment, das durch einen Funktionstyp identifiziert ist.
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BIO :: db :: gff :: Feature Beschreibung

BIO :: db :: gff :: feature ist ein relatives Segment, das durch einen Funktionstyp identifiziert wird. BIO :: db :: gff :: Feature ist ein relatives Segment, das von einem Feature-Typ identifiziert wurde. Es erbt von Bio :: db :: gff :: Relsegment, und hat die Unterstützung der relativen Adressierung dieser Klasse und ihrer Vorfahren. Es erbt auch von BIO :: SEQFEATUREI und hat also die bekannten Start (), STOP (), primäre_tag () und Standort () -Methoden (es implementiert auch Bio :: Standorti, falls erforderlich) .BIO :: db :: gff: : Funktion fügt neue Methoden hinzu, um den Typ, der Gruppe und andere GFF-Attribute der Anmerkung abzurufen. Anmerkungstypen werden durch BIO :: db :: gff :: typename-Objekte, eine einfache Klasse, mit zwei Methoden, die als Methode () und Source () aufweist, vertreten. Diese entsprechen den Methoden- und Quellfeldern einer GFF-Datei.Andotationsgruppen dienen dem doppelten Zweck, der Anmerkung einen human-lesbaren Namen zu geben und Gruppierungen von Unterfesten mit höherer Ordnung in Merkmale mit höherer Ordnung bereitzustellen. Die von diesem Modul zurückgegebenen Gruppen sind Objekte des BIO :: db :: gff :: featurname class.bio::db:::GFF::Beature Erbt von und implementiert die abstrakten Methoden von BIO :: SEQFeaturei, wodurch sie mit der Interoperation von Andere BIOperl-Module Wichtiger Hinweis zum Start () vs ende (), wenn Merkmale von Segmenten abgeleitet werden, die eine relative Adressierung verwenden (die Standardeinstellung ist), dann ist Start () weniger als Ende (), wenn sich das Merkmal auf dem gegenüberliegenden Strang von der Referenzsequenz befindet . Dies bricht BIO :: SEQI-Compliance, ist jedoch notwendig, um die von Start- () und End- () -Stauschplätze benannten echten genomischen Orte zu vermeiden. Funktionen davon. Dies wird alles in absolute Koordinaten zwingen.für Beispiel: Mein $ Segment = $ db-> Segment ('chromosome_i'); $ segment-> absolut (1); Meine @Features = $ Segment-> Funktionen ('Transkript'); Anforderungen: · Perl.

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