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Perl-Modul Klasse Bioperl bioperl Klasse Sequenzen Ausrichtung.

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BIO :: Werkzeuge :: Run :: Piseapplication :: Align2Model ist eine Bioperl-Klasse für Align2Model - Erstellen Sie eine mehrfache Ausrichtung von Sequenzen ... Bio :: tools :: run :: piseapplication :: align2model ist eine bioperl-Klasse für Align2Model - Erstellen Sie eine mehrfache Ausrichtung von Sequenzen an ein vorhandenes Modell.Parameters: Align2Model (String) Run (String) Runname DB (Sequenz)-Sequenzen ausführen, um auszurichten (-db) modell_file (Infin) Modell (-I) PIPE: SAM_MODEL ID (String) Sequenzkennung (S) Selektion (Trennen durch Kommas) (-ID) NScoreSEQ (Ganzzahl) Maximale Anzahl der zu lesenden (-nscoreseq) ADPSTYLE (excl) Dynamischer Programmierstil (-Wermig (excl) -Artyle SW (excl) Sequence Scoring (-W) Auto_Fim (Switch) Fügen Sie FIMS automatisch (-Auto_Fim) JUMP_IN_PROB (Float) -Wartungswahrscheinlichkeitskosten für den Springen in die Mitte des Modells (-Jump_in_prob) Jump_out_prob (Float) Wahrscheinlichkeitskosten, um das Mitte des Modells auszuspringen (-jump_out_prob) A2MDOTs (Switch) Druckpunkte zum Füllen des Platzbedarfs für andere Sequenzen 'Insertions (-A2MDOTs) Dump_Parameters (aus) (-Dump_Parameters) Anforderungen: · Perl.

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