BIO :: Werkzeuge :: BLITE :: HSP BIO :: Werkzeuge :: BPLITE :: HSP ist ein hochrangiger Bericht mit hoher Scoring-Paar (HSP).
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Perl-Modul Ritzen Bioperl Blast-Bericht Hohe Scoring-Pair Hsp

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BIO :: tools :: bplite :: hsp ist ein hochrangiges Bericht mit hohem Scoring-Paar (HSP). BIO :: tools :: bplite :: hsp ist ein hochrangiger Bericht High Scoring-Paar (HSP) .synopsis Verwenden Sie BIO :: Tools :: BLITE; mein $ report = new bio :: tools :: bplite (-fh => * stdin); {While (My $ sbjct = $ report-> nextsbjct) {während (My $ HSP = $ sbjct-> nexthsp) {$ hsp-> Score; $ Hsp-> Bits; $ HSP-> Prozent; $ HSP-> P; $ HSP-> Übereinstimmung; $ hsp-> positiv; $ Hsp-> Länge; $ HSP-> QuerySeq; $ HSP-> SBJCTSEQ; $ hsp-> homologyseq; $ HSP-> Abfrage-> Start; $ HSP-> Abfrage-> Ende; $ HSP-> Treffer-> Start; $ HSP-> HIT-> Ende; $ HSP-> HIT-> SEQ_ID; $ HSP-> HIT-> Überschneidungen ($ Exon); }} # Die folgende Zeile führt Sie zum nächsten Bericht in der Stream / File #, in dem es 0 zurückgibt, wenn dieser Bericht leer ist, # aber das gilt für einen leeren Blog-Bericht. # Kehrt -1 für EOF zurück. Letzter, wenn $ Bericht -> _ parseheader == -1; Redo} Dieses Objekt behandelt die Daten für hohe Scoring-Paare für einen Blog-Bericht. Hier werden die prozentuale Identität, Abfrage-, Abfrage- und Hit-Sequenzlänge, P-Wert usw. gespeichert und wo sich die meisten der erforderlichen Informationen befinden, wenn sich die logische Analyse in der Analyse eines Blog-Berichts analysieren. Anforderungen: · Perl.

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