BIO :: SEQ :: SEQWithQuality BIO :: SEQ :: SEQWithQuality ist ein Bioperl-Objekt, das eine Sequenz mit seiner Qualität verpackt.
Jetzt downloaden

BIO :: SEQ :: SEQWithQuality Ranking & Zusammenfassung

BIO :: SEQ :: SEQWithQuality Stichworte

Perl-Modul Objekt Reihenfolge Bioperl Bioperl-Objekt Sequenzverpackung

BIO :: SEQ :: SEQWithQuality Beschreibung

BIO :: SEQ :: SEQWithQuality ist ein Bioperl-Objekt, das eine Reihenfolge mit seiner Qualität verpackt. BIO :: SEQ :: SEQWithQuality ist ein Bioperl-Objektverpackung Eine Sequenz mit seiner Qualität.Synopsis verwenden BIO :: primärseq; Verwenden Sie Bio :: SEQ :: Primalqual; # Machen Sie aus der Erinnerung meine $ qual = bio :: seq :: seqwithquality-> neu (-qual => '1020304050502010 ', -Seq =>' atcgatcg ', -id =>' human_id ', -Accession_number => 'AL000012',); # Erstellen Sie zuerst aus Objekten #, erstellen Sie ein primäres Objekt-Objekt My $ seqobj = bio :: primärseq-> neu (-Seq => 'atcgatcg', -id => 'Genefragment-12', -Accession_number => 'x78121', - Alphabet => 'DNA'); # Jetzt ein Primalqual-Objekt machen My $ QualoBJ = BIO :: SEQ :: Primalqual-> Neu (-Qual => '1020304050502010 ', -Id =>' Genefragment-12 ', -Accession_number => 'X78121', -alphabet => 'DNA'); # Jetzt mache das SEQWithQuality-Objekt mein $ swqobj = bio :: seq :: seqwithquality-> neu (-Seq => $ seqobj, -qual => $ qualolobj); # fertig! $ SWQOBJ-> ID (); # Die ID des SEQWithQuality-Objekts # kann nicht mit der ID der Reihenfolge oder der Anzahl der Qualität übereinstimmen (Überprüfen Sie die Pod, Luke) $ SWQOBJ-> SEQ (); # Die Reihenfolge des SEQWithQuality-Objekts $ SWQOBJ-> Qual (); # Die Qualität des SEQWithQuality-Objekts #, um Teile der Sequenz herauszuholen. Drucken "Sequenz", $ SEQOBJ-> ID (), "mit dem Beitritt", $ SEQOBJ-> Beitritt, "und Desc", $ SEQOBJ-> DESC, "N"; $ string2 = $ seqobj-> subseq (1,40); Anforderungen: · Perl.

BIO :: SEQ :: SEQWithQuality Zugehörige Software