BIO :: Matrix :: psm :: InstanceSite BIO :: Matrix :: PSM :: InstanceTite ist ein PSM-Site.
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BIO :: Matrix :: psm :: InstanceSite Beschreibung

BIO :: Matrix :: PSM :: InstanceTite ist ein PSM-Site. BIO :: Matrix :: PSM :: InstanceSite ist ein PSM-Site ACTUR.Synopsis Verwenden Sie BIO :: Matrix :: psm :: InstanceSite; #Sie können entweder ein Instanceite-Objekt aus einer Datei erhalten: Meine ($ Instanzen, $ Matrix) = $ somepsmfile-> parse_next; #oder aus Speicher My% Params = (SEQ => 'Tataat', ID => "Tatabox1", Beitritt => 'ENSG00000122304', Mid => 'TB1', DESC => 'Tata-Box, experimentell in PRM1-Gen verifiziert' , Relpos => - 35); Abstrakte Schnittstelle zum PSM-Site-Ereignis (PSM-Sequenz-Match). Instanzen-Objekte können verwendet werden, um eine PSM zu beschreiben (siehe BIO :: Matrix :: psm :: Sitematrix) Sequenzübereinstimmungen. Das übliche Merkmal eines solchen Übereinstimmungen ist Sequenzkoordinaten, Score, Sequence and Sequence (Gene) Identifier-Zugangsnummer oder andere ID.Das Objekt erbt von BIO :: Locatableseq (die die echte Reihenfolge definiert) und kann ein Sitematrix-Objekt aufnehmen, das verwendet wird Um das CRE-Regulierungselement (CIS-Regulatory-Element) zu erkennen oder aus diesem CRE zu erstellen das gleiche cis-regulatorische Element in der stromaufwärtigen Region des gleichen Gens. Daher wären Relpos das dritte Element, um eine wirklich einzigartige Kombination zu erstellen. Anforderungen: · Perl.

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