BIO :: Baum :: Nodesi Schnittstelle, die einen Baumknoten beschreibt
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Schnittstelle, die einen Baumknoten beschreibt BIO :: Tree :: NODEI ist eine Perl-Schnittstelle, die einen Baumknoten beschreibt # Lesen Sie in einem Clustalw NJ in Phylip / Newick-Format My $ TreeIo = Neuer Bio :: Treesio (-Format => 'newick', -file => 'Datei.dnd'); mein $ Tree = $ taumio-> next_tree; # Wir gehen davon aus, dass es für Demo-Zwecke funktioniert #, die Sie möglicherweise testen möchten, dass es mein $ rootNode = $ tree-> get_root_node definiert wurde. # PROCECT Just The Next Generation Deeach My $ -Node ($ rootnode-> jeweils_descendent ()) {drucken "Zweig len ist", $ node-> branch_length "," ";} # Bearbeiten Sie alle Kinder, die mein $ example_hleaf_node; foreach mein $ -Node ($ roadnode-> get_all_descendents ()) {if ($ node-> is_leaf) {drucken" Knoten ist ein Blatt ... "; # zum Beispiel Verwendung Unter $ Beispiel_hleaf_node = $ -Knoten, es sei denn, $ explich_hleaf_node;} drucken "Zweig len ist", $ node-> branch_length, " ";} # Die Methode von Ahnen () zeigt auf den Elternteil eines Knotens # A-Knotens kann nur ein übergeordnetes übergeordnetes $ übergeordnet = $ example_leaf_node-> acstor; #-Elternteil wird wahrscheinlich keine Beschreibung haben, da es sich um einen internen Knoten # handelt Aber das Kind wird, weil es ein Blattdruck ist "Eltern-ID:", $ übergeordnete -> ID, "untergeordnete ID:", $ example_leaf_node-> ID, " "; Ein Nodeei ist in der Lage, eine grundlegende Struktur des Bauens eines Baumes zu errichten und die Verzweigungslänge zwischen den Knoten zu speichern. Die Verzweigungslänge ist die Länge des Zweigs zwischen dem Knoten und seinem Vorfahren, somit hat ein Wurzelknoten in einem Baum nicht typischerweise a Gültige Verzweigungslänge Bitte fragen Sie, freuen Sie sich, wir würden auch die Beiträge mit Verbesserungen oder Erweiterungen der Objekte an den Bioperl-Codebasis erkennen, damit andere Ihre Ideen nicht neu erfinden müssen. Anforderungen: · Perl.

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