BIO :: BIBLIO.

BIO :: BIBLIO ist ein bibliographisches Query-Service-Modul.
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BIO :: BIBLIO. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Perl Artistic License
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Martin Senger
  • Website des Verlags:
  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-run-1.4/Bio/Tools/Run/Analysis.pm

BIO :: BIBLIO. Stichworte


BIO :: BIBLIO. Beschreibung

BIO :: BIBLIO ist ein bibliographisches Abfrage-Service-Modul. BIO :: BIBLIO ist ein bibliographisches Abfrage-Service-Modul.Synopsis Verwenden Sie BIO :: BIBLIO; mein $ biblio = neuer bio :: biblio; Drucken $ biblio-> Suche ('perl') -> get_count. "n"; Meine $ collection = $ biblio-> Find (Brazma ',' Autoren); während ($ sammlung-> has_next) {drucken $ collection-> get_next; } #Die neue () -Methode kann Parameter erhalten, zum Beispiel: $ biblio = bio :: biblio (-Abcess => 'Seife', -Location => 'http://industry.ebi.ac.uk/soap/openbqs ', -destroy_on_exit =>' 0 '); # Siehe unten für einige One-LinerThis ist eine Klasse, deren Instanzen auf bibliographische Repositorys zugreifen kann. Es ermöglicht das Abfragen einer bibliographischen Datenbank (z. B. Medline) und dann, um resultierende Zitate davon abzurufen. Die Zitate werden in einem XML-Format zurückgegeben, das im Repository nativ ist, es gibt jedoch auch Module zum Umwandeln in Perl-Objekte. Die detaillierten Beschreibungen aller Abfrage- und Abrufmethoden befinden sich in BIO :: db :: biblioi (eine Schnittstelle). Alle diese Methoden sollten auf Instanzen dieses Moduls (BIO :: BIBLIO) aufgerufen werden. Das Modul entspricht (mit einigen Vereinfachungen) mit der im OpenBQS-Projekt beschriebenen Spezifikation. Die Startseite befindet sich unter http://industry.ebi.ac.uk/openbqs. Es gibt auch Links zu den verfügbaren Servern, die den Zugriff auf die bibliographischen Repositorys (nämlich zu Medline) bieten. Das Modul ergibt auch Zugriff auf eine Reihe von kontrollierten Vokabeln und deren Werte. Es ermöglicht den Introspekte von bibliographischen Repositorys und sollen feststellen, welche Zitat-Ressourcentypen (z. B. Journal- und Buchartikel, Patente oder technische Berichte) bereitgestellt werden, und welche Attribute sie haben, welche Attributwerte erlaubt sind. Hier sind einige One-Liner: perl -MbIO :: BIBLIO -E 'DRUCKE NEU BIO :: BIBLIO-> GET_BY_ID ("94033980")' Perl -mbio :: BIBLIO -E 'Print Join ("N", @ {New Bio :: biblio-> Find ( "Brazma") -> get_all_ids}) 'perl -mbio :: biblio -e' drucken Neue Bio :: biblio-> Suche ("Java") -> Finden ("Perl") -> Get_Count 'Anforderungen: · Perl.


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