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BIO :: Alignio :: MSF Ranking & Zusammenfassung
- Lizenz:
- Perl Artistic License
- Name des Herausgebers:
- Peter Schattner
- Website des Verlags:
- http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/Tools/BPlite/HSP.pm
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BIO :: Alignio :: MSF Beschreibung
BIO :: Alignio :: MSF ist ein Perl-Modul mit MSF-Sequenz- / Ausgabestrom. BIO :: Alignio :: MSF ist ein Perl-Modul mit MSF-Sequenz-Ein- / Ausgabestrom.SynopsisDo Verwenden Sie dieses Modul nicht direkt. Verwenden Sie es über die BIO :: Alignio-Klasse. Dieses Objekt kann BIO :: ALIGN :: Aligni-Objekte in und von MSF Flat-Datendatenbanken transformieren. Der Rest der Dokumentation dabei jede der Objektmethoden. Interne Methoden werden in der Regel mit einem _Next_alntitle vorausgehen: next_alnuage: $ ALN = $ bream-> next_aln () -Funktion: Gibt die nächste Ausrichtung in den Stream zurück. Versuche zu lesen * Alle * MSF Es liest alle Nicht-Leerzeichen-Zeichen im Ausrichtungsbereich. Für MSFs mit seltsamen Lücken (z. B. ~~~) kartet sie mit $ al-> map_chars ('~', '-') zurück ('~', ' > Write_aln (@aln) -Funktion: Schreibt das $ ALN-Objekt in den Strom in den Stream in der MSF-Format-Sequenzart der Ausrichtung wird von der ersten Sequenz bestimmt.Returns: 1 für Erfolg und 0 für errorargs: l Objektanforderungen: · Perl.
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