Aufgeteilt Split-Dist berechnet die Anzahl der Splits (Kanten), die sich für zwei Bäume unterscheidet.
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Berechnung Newick-Format Newick. Splits berechnen. Kanten berechnen Split-Dist

Aufgeteilt Beschreibung

Split-Dist berechnet die Anzahl der Splits (Kanten), die sich für zwei Bäume unterscheidet. Split-Dist berechnet die Anzahl der Splits (Kanten), die sich für zwei Bäume unterscheidet. Das split-dist-Programm, SDIST, liest in einem Satz von Bäumen in Newick-Format und berechnet, welche der Kanten / Splits zwischen ihnen geteilt werden. Das Ergebnis ist in Form einer Matrix gegeben, in der Eintrag i, j die Anzahl der Kanten in Baum I gibt, die auch in Tree J.Statistics um die nicht geteilten Splits gefunden werden, die nicht zwischen zwei Bäumen geteilt werden, können ebenfalls berechnet werden. Dies geschieht durch Inspektion, für jedes nicht triviale Split-Splits mit mehr als einem Blattelement auf beiden Seiten der Kante - die Größe der kleinsten der beiden Sätze in der Split A | b. Die maximale, minimale und Durchschnittsgröße des kleinsten Satzes in den nicht gemeinsam genutzten Splits werden berechnet und berichtet. Diese Statistik gibt einen Hinweis darauf, wie "Local" die Unterschiede zwischen den beiden Bäumen liegen . Das Werkzeug kann auch den Satz von Splits in einem beliebigen Baum (mit einer Zählung dessen, wie oft der Split gefunden wird) berechnen, und der Satz von Splits, die von allen Bäumen in der Set.information geteilt werden, über die sich Splits in einem Baum in einem Baum befinden, werden auch in der Andere Bäume können in einem kommentierten Baum gemeldet werden. Dieser Baum, der in Newick-Format ausgegeben wird, hat die gleiche Topologie wie der erste Baum, aber die Kanten werden jedoch als Unterbaum f: Niederlassung, wobei f die Fraktion der Bäume ist, die die Kante enthält, dh 1, wenn das Die Kante wird von allen Bäumen oder 0,5 unterstützt, wenn nur die Hälfte der Bäume den Edge enthält.Installation: Das Split-Dist-Paket ist in C ++ geschrieben. Es sollte auf jedem UNIX-System kompilieren. Laden Sie zum Installieren des Pakets den Quellcode herunter und entpacken Sie ihn (TAR XZF Split-Dist-ABCTAR.GG, wo ABC die Versionsnummer von Split-Dist ist), und führen Sie dann Konfigurieren aus, und erstellen Sie im Unterverzeichnis Split-Dist-ABC erstellt beim Auspacken. Dadurch entsteht das split-dist-Programm, SDIST zusammen mit einer Reihe von Testprogrammen. Um zu überprüfen, ob alles richtig ging, fahren Sie an. Wenn alle Tests übertragen, installieren Sie das SDIST-Programm, indem Sie das SDIST-Programm durchführen. Lesen Sie die Installationsdatei für mehr Info.was neu in dieser Version: · Ein fehlender virtueller Destruktor wurde behoben.

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