| AMEN Amen ist eine einheitliche Suite von Tools, um biologische, vielfältige Hochdurchsatz-Daten zu verwalten, zu erforschen und zu kombinieren. |
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AMEN Ranking & Zusammenfassung
- Name des Herausgebers:
- Frdric Chalmel
AMEN Stichworte
AMEN Beschreibung
Amen ist eine einheitliche Suite von Tools, um biologische, vielfältige Hochdurchsatz-Daten zu verwalten, zu erforschen und zu kombinieren. Amen steht für Anmerkung, Zuordnung, Ausdruck und Netzwerk und ist ein eigenständiger, einheitlicher Suite von Werkzeugen, um biologische, vielfältige Hochdurchsatzdaten wie Anmerkung, chromosomale Standort, Expression und Interaktionsdaten zu verwalten, zu verwalten und zu kombinieren. Anforderungen: · Tcl / tk Was ist neu in dieser Version: 7 Module: · Modul zum Schätzen, wenn eine biologische Einheit (Protein für das Beispiel) interagiert oder reguliert, oder reguliert mehr Gene / Proteine in einem Cluster von Genen in Bezug auf ganze Gene (Anreicherung auf regulatorischen oder Interaktionsnetzen). Geschrieben von Aurélie Lardenois. · Modul, um diese Anreicherungen als Netzwerk zu visualisieren. Geschrieben von Aurélie Lardenois. · Zwei Module für semi-überwachte K-Mittel- und PAM-Methoden. · Modul, um Gene-Set-Dateien (.gmt-Dateien von GSEA) in die Anmerkungsdatei hinzuzufügen. · Modul, um mit positiven oder negativen Steuergenen zu normalisieren. · Modul, um die Samples in einer Expressionsdatei neu zu organisieren Zwei Änderungen: · Beim Importieren von Gruppendateien werden sie jetzt in der alphabetischen Reihenfolge sortiert und dann in Amen importiert · Das Installationsmodul R-Pakete wurde modifiziert.
AMEN Zugehörige Software