ProsatProteinrückstand Anmerftoolkit | |
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Prosat Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Name des Herausgebers:
- Huzefa Rangwala
- Betriebssysteme:
- Windows All
- Dateigröße:
- 363 KB
Prosat Stichworte
- Anmerkung Annotation-Plug-In Anmerkung SDK. Anmerkung ActiveX. Protein Video Anmerkung. abrufen von Protein Protein analysieren vergleichen Protein PDF-Anmerkung. geometrische Anmerkung. semantische Annotation Diagramm Anmerkung. Proteinmolekül Annotationsbibliothek. Anmerkungsprozessor. Bild Anmerkung. Annotation der lexikalischen Kohäsion halbautomatische Anmerkung Annotation-Zuhörer Restliche Anmerkung Symbol Annotation debuggen. Anmerkung CLI. Text Anmerkung. Anmerkung erstellen Proteinkennzeichnung. Proteinsynthesizer. Proteinkristallisation. Protein Translocation. Proteinliste Proteinvisualisierung. Sequenz Annotation Annotation-Tool Anzahl Anmerkung. ruby-Annotationen Annotation der Website. Ansicht Annotation Annotationsprozess Transcript-Anmerkung. Proteinstrukturen Raffinement Proteinstruktur. Geometrische Proteinmerkmale chromosomale Anmerkung. Gen Annotation Bildanmerkung. Assay Annotation. Anmerkung zuordnen Code Anmerkung. Audio-Annotation. Regulierte Proteintraination. reguliertes Protein bestätigen Protein-Viewer quadratischer Rückstand quadratischer Nichtrest Rückstand Mindestens quadratischer Nichtrückstand Annotation Mapper. Anmerkung Analysator Intuitiven Anmerkung. Proteindatenbank analysieren Proteinentwicklung. Proteintest Annotation zeichnen Protein-Dichroismus Proteinstrukturen. Datenanmerkung. Ontologie-basierte Annotation Proteinrest Aminoacid-Rückstand SVM Builder Funktionsanmerkung. cDNA-Annotationssystem. Proteinkomplex auswerten Proteinkomplexvorhersage. Proteinkomplex anzeigen. Rückstand Prozent Aminosäurerest Proteinbrowser Struktur Anmerftation vorbereiten. Brookhaven-Protein-Datenbank Annotation Editor Ansicht Protein-Datei Proteinanalysator. Weltwind Anmerkung. Annotation anzeigen. Annotation machen Ort Annotation Kartenanmerkung. Anmerkungskontrolle. Proteinsequenzen anzeigen. Proteinsequenzen-Viewer. Nukleotidannotation. Protein Evolution Simulation. Protein ausrichten Protein visualisieren Maskottchen-Protein. Peak Annotation. Protein-Interaktion Protein rendern Protein-Dateien anzeigen. Proteindatenbank verwalten Protein-Vizualisierer. Protein 3D-Struktur. Kodak Anmerkung. Spielanleitung xHarbour activex XLs an DTD. DivX-Codec Linux. Toshiba-Videocontroller. Karaoke-Songs für Unforeze 7.00.020.3172. ZWECKFORM CD-Label. AutoCAD 2008 runter ISO R773 PDF.
Prosat Beschreibung
Das ProSat-Toolkit wurde entwickelt, um ein Satz von Programmen zu sein, mit denen das Bauen von SVM-basierten Modellen zum Annotieren von Aminosäureresten in Proteinsequenzen unter Verwendung von benutzergerichteten Funktionen (wie PSI-BLAST-Profile oder PSIPRED-Profile) ermöglicht. Insbesondere erstellt das Toolkit Merkmale mit einem Fenster um den Rückstand und ist zusammen mit einer speziellen Kernelfunktion (Normalized Second Order Exponential Kernelfunktion NOE) zusammen mit der Standard-SVM-Kernel-Funktion ausgestattet. ProSat_Learn ist das Programm, um "n" ein-gegen-Rest-Klassifizierungsmodelle lernen, wobei n die mögliche Anzahl von Anmerkungen ist. Es kann auch ein Support-Vektor-Regressionsmodell erlernen, um einen schwebenden Punktwert vorherzusagen. Verwendung ProSat_Learn ProSat_PREDICT ist das Programm, um die Anmerkung für jeden Rückstand von den eingebauten Modellen vorherzusagen und ein L xn-Dimensionsprofil auszugeben, das die Punktzahl von jedem der N one-versus- Rest SVM-Modelle für jeden Aminosäurerest und L ist die Länge der Proteinsequenz. Im Falle eines Regressionsmodells n = 1. Verwendung ProSat_Predict. Eingang ProSat_Predict hat drei erforderliche Parameter: - Testdatei: Die Testdatei enthält die Liste der Sequenzfunktionen, für die wir die Anmerkungsprofile vorhersagen müssen. Es ist ähnlich der in ProSat_learn verwendeten Eingabedatei, außer dass es nicht die Namen der True Annotation-Dateien enthält, da wir das gleiche vorhersagen. - Modelldatei: Die Modelldatei ist die von ProSat_Learn ausgegebene Modelldatei - Vorhersagedatei: Die Vorhersagedatei bietet den Pfad und das Präfix der Ausgabevorhersagen in Form von Anmerkungsprofilen. Ausgang Der Ausgang besteht aus einer Reihe von vorhergesagten Annotationen und Profilen, die nur die SVM-Vorhersagen von jedem der "Num-Element" -S-SVM-Modelle sind.
Prosat Zugehörige Software
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TetraPLOODMAP ist eine grafische Benutzeroberfläche für die Berechnung von Verbindungskarten ...
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