FragmentationAnalyzer.

ein eigenständiges Java-Tool zur Analyse von MS / MS-Fragmentierungsdaten
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FragmentationAnalyzer. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Apache License 2.0
  • Name des Herausgebers:
  • Harald Barsnes, Lennart Martens
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 12.2 MB

FragmentationAnalyzer. Stichworte


FragmentationAnalyzer. Beschreibung

Fragmentationsanalysator ist ein Java-basiertes Open-Source-Instrument, mit dem MS / MS-Fragmentierungsdaten analysiert werden können. Neun verschiedene Analysearten werden unterstützt: · Spectra-Visualisierung - visualisieren Sie die MS / MS-Spektren mit Fragment-Ionen-Annotation, Zoomen und manuelle De-Novo-Sequenzierung. · Intensitätskasten-Plots - Intensitätsänderung analysieren, um eine Identifizierung desselben Peptids zu ermitteln. · Intensitätskorrelation - erkennen, wie die Intensität mit der Intensität der Spreizung korreliert. · Intensitätsmetabellen - Analysieren Sie die Intensitätsänderungen weiter. · Massenfehler-Scatter-Plots - Visualisieren Sie den Massenfehler in einem Satz ausgewählter Identifizierungen / Spektren. · Massenfehlerblasen-Plots - gleich wie Massenfehler-Scatter-Plots, jedoch mit spitzen Intensitäten hinzugefügt. · Massenfehler-Box-Plot - Analysieren Sie die Variation in Massfehlern. · Fragmentionenwahrscheinlichkeitsgrafik - Analysieren Sie die Wahrscheinlichkeit, bestimmte Fragmentionen zu beobachten. · Fragmentionen-Wärmeleitung - Vergleichen Sie die Fragmentierung mithilfe von Wärmekarten der Korrelationsdaten. Haupteigenschaften: unterstützt drei Eingabeformate: ms_lims 7 maskottchen dat-Dateien omssa omx files


FragmentationAnalyzer. Zugehörige Software