Signalisierungsanalyse und Visualisierung

Eine Software zum Berechnen des Clustering, des Durchmessers, der Konnektivitätsverteilung und des Erkennens und der Visualisierung von Netzwerkmotiven
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Signalisierungsanalyse und Visualisierung Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Mount Sinai School of Medicine Iyengar Lab
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 19.6 MB

Signalisierungsanalyse und Visualisierung Stichworte


Signalisierungsanalyse und Visualisierung Beschreibung

Der Entdeckungsprozess von zellulären Signaltransduktionspfaden hat eine Bühne erreicht, in der Pfade kombiniert werden, um große Netzwerke von Wechselwirkungen zu bilden. Anzeigen von Protein-Protein- und Liganden-Protein-Wechselwirkungen als Diagramme (Netzwerke), in denen Bio-Moleküle als Scheitelpunkte (Knoten) und Wechselwirkungen dargestellt werden, als Kanten (Links) dargestellt werden, ist ein nützliches Verfahren zum Konsolidieren und Organisieren experimenteller Beweise aus mehreren Quellen, um das System zu erreichen -Level Verständnis dafür, wie die Wege zelluläre Phänotypen kontrollieren. Die Entstehung von Datensätzen aus großen Netzwerken aus zellulären Komponenten und Interaktionen bietet die Möglichkeit zur statistischen topologischen Analyse und der Herausforderung der Netzwerkvisualisierung. Graph-Theorie-Methoden, die auf komplexe Systeme in anderen Bereichen angewendet werden, werden ebenfalls angewendet, um biomolekulare Mobilfunknetze zu analysieren. Savi ist ein Desktop-Programm, das Standardmethoden implementiert, um den Clustering, des Durchmessers, die Konnektivitätsverteilung und das Erkennen und Visualisieren von Netzwerkmotiven zu berechnen. Darüber hinaus generiert Savi eine vollständige Website von den Netzwerkdatasets im Textformat. Savi enthält ein Werkzeug namens Pathwaygenerator. Dieses Tool erstellt Signalisierungsverbindungskarten als Webseiten aus großen Datasets von Wechselwirkungen. Savi kann auch ein Netzwerk von Interaktionen erstellen, wenn eine Liste der Human-Gen-Namen vorliegt.


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