Savi-Signalisierungsanalyse und -visualisierung

Analysieren und Visualisieren von zellulären Signalen und Netzwerken aus zellulären Komponenten.
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Savi-Signalisierungsanalyse und -visualisierung Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Free
  • Name des Herausgebers:
  • Mount Sinai School of Medicine Ma'ayan
  • Website des Verlags:
  • http://www.mssm.edu/labs/maayan
  • Betriebssysteme:
  • Windows Me, Windows 98, Windows 95, Windows 2000, Windows NT, Windows XP
  • Dateigröße:
  • 20.35MB

Savi-Signalisierungsanalyse und -visualisierung Stichworte


Savi-Signalisierungsanalyse und -visualisierung Beschreibung

Anzeigen von Protein-Protein- und Liganden-Protein-Wechselwirkungen als Diagramme (Netzwerke), in denen Biomoleküle als Knoten dargestellt werden, und ihre Wechselwirkungen sind als Verbindungen dargestellt, ist ein vielversprechender Ansatz zur Integration experimenteller Ergebnisse aus verschiedenen Quellen, um ein systematisches Verständnis von molekularen Mechanismen zu erreichen, um den Phänotyp mit molekularen Mechanismen zu erreichen . Die Entstehung von Signalnetzwerken mit großem Maßstab bietet eine Gelegenheit für die topologische statistische Analyse, während die Visualisierung solcher Netze eine Herausforderung darstellt. Savi implementiert Standardmethoden, um die Clustering, Connectivity Distribution und Erkennung sowie die Visualisierung von Netzwerkmotiven zu berechnen. Darüber hinaus generiert Savi eine vollständige Website von den Netzwerkdatasets im Textformat. Savi enthält ein Werkzeug namens Pathwaygenerator. Dieses Tool erstellt Verbindungskarten als Webseiten von großen Tabellen, die Zellsignal-Wechselwirkungen beschreiben. Savi kann auch Netzwerke aus Listen von Gen- / Protein-Namen erstellen. Version 2.5 kann nicht spezifizierte Updates, Verbesserungen oder Fehlerbehebungen enthalten.


Savi-Signalisierungsanalyse und -visualisierung Zugehörige Software

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