Punktdiagramm DOT-Plot-Analyse-Tool
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Punktdiagramm Ranking & Zusammenfassung

Punktdiagramm Stichworte

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Punktdiagramm Beschreibung

Versuchen Sie, zwei neuronale Nicotinic Acetylcholin-Rezeptor-Untereingriffsequenzen von SwissProt zu vergleichen, die unter den Dateinamen A2 und A3 gespeichert sind. Die Schnittstelle ist wie jedes andere Windows-Programm. Verwenden Sie das Datei-Popup-Menü, um die horizontale Reihenfolge zu laden. Sie erhalten ein Dialogfeld, das alle Dateien in dem aktuellen Verzeichnis auflistet. Wählen Sie A2 aus, dann gibt das Programm ein SEQInfo-Dialogfeld, das Ihnen ein wenig über die Sequenz zeigt, die Sie gerade geladen haben, dh. Sein Name, Länge, Sequenzformat und ob es sich um DNA, RNA oder Eiweiß handelt. OK klicken. Wiederholen Sie dann für die vertikale Reihenfolge, wählen Sie A3 aus. Wie in der MSDOS-Version gibt es zwei Möglichkeiten, den detaillierten detaillierten detaillierten DOTPLOT zu berechnen. Verwenden Sie für einen schnellen Fix die Option Identitäten im Menü Draw Popup. Die Standardparameter sind eine Fenstergröße von 10 und einen Schwellenwert von 6. Dies gibt eine Diagonalzeile über den Bildschirm. Versuchen Sie, das DOTPLOT zu aktivieren, indem Sie auf Parameter klicken und den Schwellenwert auf 1. Hübsch, nicht? Sie können sogar die drei Transmembranbereiche in der Mitte des Proteins und der endgültigen Transmembran an der C-Terminus sehen. Versuchen Sie, die internen Wiederholungen in einem menschlichen Epidermal-Wachstumsfaktor-Rezeptor zu finden. Laden Sie dazu die Sequenz namens EGFR sowohl als Horizontal als auch die vertikale Reihenfolge. Stellen Sie dann die Parameter als Fenster = 20 und Threshold = 1 ein. Laden Sie die PAM250.MAT-Score-Matrix mit dem Datei-Popup-Menü "Matrix öffnen". Die DOTPLOT-Anwendung wurde entwickelt, um ein DOT-Plot-Analyse-Tool zu sein.

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