Phylod Microsoft Computational Biology Tools-Komponente
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Phylod Ranking & Zusammenfassung

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Phylod Beschreibung

Krankheitserreger leben und reproduzieren innerhalb des menschlichen Gastgebers, dessen Immunsystem ständig versucht, den Körper dieser Erreger zu befreien. Dies führt zu einem Kriegszeigersinn zwischen dem Erreger und dem menschlichen Wirt, wo der Erreger versucht, sich an das Immunsystem "entfliehen", während das Immunsystem neue ausländische Erreger erkennt und beseitigen lernt. Ein Satz Schlüsselakteure für das Immunsystem sind die HLA-Proteine, von denen jeder spezifische kurze Fragmente ausländischer (z.G. HIV) -Proteine erkennen kann, die Epitope infizierten Zellen genannt werden und dann das Immunsystem auf ihre Anwesenheit aufmerksam machen. Bei schnell weiterentwickelnden Erreger wie HIV besteht ein Schlüsselabwehrmechanismus darin, Mutationen zu entwickeln, die verhindern, dass die HLA-Proteine die virale DNA erkennen. Diese Evolution findet an jedem Patienten neu statt, da jeder Patient einen anderen Satz von HLA-Proteinen hat, die unterschiedliche Epitope erkennen. Phylod ist ein statistisches Werkzeug, das HIV-Mutationen identifizieren kann, die die Funktion der HLA-Proteine bei bestimmten Patienten besiegen, wodurch das Virus durch das Immunsystem eliminiert werden kann. Durch die Anwenden dieses Instruments an große Studien an infizierter Patienten können Forscher jetzt beginnen, die komplexen Regeln zu dekodieren, die die HIV-Mutationen regieren, in der Hoffnung, dass ein Tag einen Impfstoff erstellt, an dem der Virus Widerstand nicht entwickeln kann. Die Pre-Compiled-Anwendung von Phylod ist ein Teil des Microsoft Computational Biology Tools-Pakets. Anforderungen: · Nettoframework.

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