Affe Ein kleiner, einfach zu bedienender Plasmid-Editor
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Editor bearbeiten Emulator IIS Apache OFR. Fügen Sie der OFR-Unterstützung hinzu Apache-Plugin APACHE-Service Apache GUI. Apache Maven Integration. Apache Maven integrieren Apache-Emulator IIS 7 Apache-Modul Apache emulieren Apache Axis2. Apache-Authentifizierung. Plasmid Apache-Datenbank. Apache httunnel Client. Apache-Monitor

Affe Beschreibung

APE wurde entwickelt, um ein kleiner, einfach zu bedienender Plasmid-Editor zu sein. Haupteigenschaften: hebt Restriktionsstellen im Bearbeitungsfenster hervor reflektiert den DAM / DCM-Blockieren von Enzymseiten genau; hebt Text mit vordefinierten und benutzerdefinierten Merkmalsbibliotheken zeigt Translation, TM,% GC, ORF ausgewählter DNA in Echtzeit liest DNA-Streiter, Fasta, Genbank und EMBL-Dateien Speichert Dateien als DNA-strider-kompatibles oder genbank-Dateiformat Highlights und Zeichnet Grafikkarten mithilfe von Feature-Anmerkungen von GenBank und EMBL-Dateien bläst direkt die ausgewählte Sequenz bei NCBI oder Wormbase Textkarte Zeigt DNA-Sequenz, Übersetzung und Funktionen als textbasierte Grafik erstellt Grafikbeschränkungsmaps- linear oder kreisförmig mit den angegebenen Funktionen Verbindet Grafik- und Textfunktionen mit Hyperlink Doppelklick speichert Grafiken als gekapselte Postscript- oder skalierbare Vektorgrafiken Kopieren und Speichern von Grafiken als Windows-Metafile (nur MS Windows) Virtueller Restriktion Digest zeichnet vordefinierte und benutzerdefinierte DNA-Leitern Verbindet Bänder mit doppelklicken Doppelklick liest abi Sequenzierung Trace-Dateien -Sequenzen in ABI-Spuren können direkt auf eine Referenzsequenz ausgerichtet werden, wobei die Ausrichtung wieder in die Ablaufverfolgung zurückblieben. wählt Sites, die mehrere Kriterien entsprechen (Union / Kreuzungsfrequenz, Site-Typ) in allen offenen Fenstern wählt Websites aus, die häufiger in einer Reihenfolge als ein anderes geschnitten werden (für Snip-SNP-Detektion oder Diagnose-Digests) hat benutzerdefinierte Enzymgruppierung, um zB zu differieren. Enzyme derzeit auf Lager. Ermöglicht Benutzern die Definition neuer Enzyme mit Namen und Erkennungsstandort Importiert DNA-Streiterformatdateien (einfaches Enzym, Standortlisten) von Rebase Die meisten Analysefenster werden mit ihren entsprechenden Sequenzen übertragen, einschließlich: Grafikkarten Textkarten Virtuelle Digests Ausrichtungen (einschließlich ABI-Sequenzen) stille Sites Translation Primer Finden Sie verwendet benutzerdefinierte Feature-Definitionsbibliotheken, die es ermöglichen: Schnelle Anmerkung der Sequenz Schnellsuche und Hervorhebung aller verfügbaren Primer, die Sie (oder andere), die Sie (oder andere) auf eine Sequenz hybridisieren lassen Sequenz zu kommentieren und auf mehrere Arten schnell und effizient zu visualisieren Grafikkarten, die Primer-Bindungsstellen und alle interessanten Sequenzfunktionen anzeigen Übersetzt Sequenzen mit optionaler DNA-Ausrichtung findet potenzielle Primer, die mit den Benutzerkriterien übereinstimmen (Länge, TM,% GC, Selbst / andere Komplementarität) Richten Sie zwei DNA-Sequenzen (oder eine beliebige Kombination von Sequenz und ABI-Trace) aus, wobei die Ausrichtung mit der ursprünglichen Sequenz übertragen wird. Findet transländische stille Restriktionsseiten zeichnet grafische Orf-Karten

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