Vorprogramm

ein Werkzeug zur Analyse geometrischer Merkmale der Proteinstruktur
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Vorprogramm Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Kliment Olechnovic
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 8.6 MB

Vorprogramm Stichworte


Vorprogramm Beschreibung

Die Fähigkeit, geometrische Merkmale der dreidimensionalen (3D-) Proteinstruktur zu analysieren und zu visualisieren, ist grundlegend für Studien zum Falten von Protein, Rückstand, Andocken, Protein-Protein-Wechselwirkungen usw. Einige der fortgeschrittenen geometrischen Datenstrukturen ermöglichen es, eine solche Leistungen durchzuführen eine Analyse auf umfassende Weise. Mit diesem Ziel haben wir Vordroprot entwickelt, ein interaktives Werkzeug zur Analyse geometrischer Merkmale der Proteinstruktur. Wir haben uns insbesondere entschieden, einige der geometrischen Methoden bereitzustellen, die nicht in anderen ähnlichen Softwarepaketen enthalten sind. Voroprot konstruiert und zeigt Apollonius-Diagramm (auch als Voronoi-Diagramm von Kugeln genannt) und das Apollonius-Diagramm (auch als Delaunay-Triangulation von Kugeln) von Proteinatomen bezeichnet, wobei jedes Atom eine 3D-Kugel von Van der Waals-Radius ist. Vorprobier leitet Proteinatome auf Kontaktflächen und lösungsmittelgerechte Oberflächen aus dem Apollonius-Diagramm und ermöglicht ihre Visualisierung. Darüber hinaus kann es Hohlräume in der Proteinstruktur finden und anzeigen. Um Apollonius-Diagramm im Vorprogramm zu erstellen, haben wir unsere eigene Algorithmus-Implementierung eingesetzt, die nicht nur für Proteinatome, sondern auch für jeden Satz von Punkten oder Kugeln in 3D angewendet werden kann. Geben Sie Vorproband einen Versuch, seine Fähigkeiten vollständig zu bewerten!


Vorprogramm Zugehörige Software

GSA

Sequenzausrichtungsanwendung, um Ihnen bei Ihrer Arbeit zu helfen. ...

220 3.5 MB

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