Viraler Genomorganisator. Genombrowser, der über Java verwendet wird
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Viraler Genomorganisator. Ranking & Zusammenfassung

Viraler Genomorganisator. Stichworte

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Viraler Genomorganisator. Beschreibung

Viraler Genomer Organizer oder Vgo erstellt, um ein benutzerfreundlicher Java-basierter Genombrowser zu sein. Es kann verwendet werden, um Informationen über ein Genom anzuzeigen, einschließlich seiner Gene, ORFs und Start- / Stop-Codons. Es kann auch verwendet werden, um eine reguläre Ausdruckssuche, eine Fuzzy-Motivsuche und eine Masslist-Suche durchzuführen. Da die VGO mit unserer Datenbank von Genomsequenzen (VOCs) spricht, kann es verwendet werden, um Genome zu vergleichen. Haupteigenschaften: Ansicht von Genen und vorhergesagt ORFs in einer oder einer Reihe von Genomen. Display starten und stoppen Sie Codons in der Reihenfolge Suchen Sie nach Sequenzen in Genomen mit regulären Ausdrücken; E.g ggatcc oder ttttt t mit einem Fuzzy-Suchmuster; z.B. GGATCC ermöglicht ein Missverhältnis für Gene mit der höchsten bei Komposition Verwenden Sie eine GUI, um Regionen eines Genoms zu wählen und zu extrahieren Displayorthologs in einem Satz Genomen, indem die GUI verwendet wird, um ein Gen in einem anderen Genom zu wählen Zeigt ein Diagramm der Nukleotidzusammensetzung an. Suchen Sie nach dem längsten Oligonukleotid, das zwischen einer Reihe uneinrichteter Genomen geteilt wird Suchen Sie das übersetzte Genom für Übereinstimmungen zu Massenspezifischen Peptiden Display Daten aus anderen Programmen auf dem Genomanzeige grafisch anzeigen

Viraler Genomorganisator. Zugehörige Software