Virale orthologische Cluster Zugriff auf die VBRC-Genomdatenbanken.
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Virale orthologische Cluster Ranking & Zusammenfassung

Virale orthologische Cluster Stichworte

Reihenfolge Proteinsequenz Genom

Virale orthologische Cluster Beschreibung

Virale orthologische Cluster (VOCs) ist eine benutzerfreundliche Java-GUI, die verwendet wird, um auf die VBRC-Genomdatenbanken zuzugreifen. Virale Ortholog-Cluster verfügen über eine einfache und umfassende Schnittstelle, die Sie schnell durch alle seine Funktionen führt. Haupteigenschaften: Suchen und Extrahieren von Genom-, Gen- und Proteindaten aus der Datenbank. Wählen Sie Daten (z. B. ein Satz von Genen) und analysieren Sie es dann mit den anderen VBRC-Tools, z. B. Erzeugen Sie mehrere Ausrichtungen mit Basis-Base-Base Erstellen Sie Dotplots mit JDOTTER Durchsuchen Sie vollständige Genome mit dem viralen Genomorganisator (vgo) Run BLAST-Suchen auf NCBI- und VBRC-Datenbanken Plot-DNA-Skews mit Dnagher Erstellen von Genomkarten Vergleichen Genome und Sets von Genomen, z. B. Finden Sie Genfamilien in allen Pockenvirusgenomen (Kernpoxvirus-Gene) Finden Sie Genfamilien in Variola-Viren, aber nicht in Cowpox- oder Vaccinia-Viren (potentielle Virulenzgene) Der VBRC verwendet eine Administrator-Version von VOCs, um Genome hinzuzufügen, Gene annotieren und Genfamilien zu klassifizieren

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