Venusmuscheln

Klassifizieren Sie Ihre Sequenzen mit diesem Tool.
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Venusmuscheln Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • The Regents of the University of California
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 20.4 MB

Venusmuscheln Stichworte


Venusmuscheln Beschreibung

Muscheln ist eine praktische Anwendung, die speziell entwickelt wurde, um Ihnen einen sequenzzusammensetzungsbasierten Klassifizierer für metagentenomische Sequenzen anzubieten. Muscheln arbeitet durch Erfassung von Unterschriften jeder Sequenz, die auf der Sequenzzusammensetzung basieren. Jede Sequenz wird in einem De-Bruijn-Diagramm als Spaziergang mit den zugrunde liegenden Markov-Ketteneigenschaften modelliert. Muscheln erfasst stationäre Parameter der zugrunde liegenden Markov-Kette sowie strukturelle Parameter des darunter liegenden De Bruijn-Diagramms, um diese Signatur zu bilden. In der Praxis wird für jede Sequenz zu Binned eine solche Signatur berechnet und an ähnliche Signaturen angepasst, die für die Trainingssätze berechnet werden. Die beste Übereinstimmung, die auch die normalisierten Entfernungsabschnitte qualifiziert. In dem Fall, dass das beste Spiel diese Abschaltung nicht qualifiziert, bleibt die Sequenz un-Binded.


Venusmuscheln Zugehörige Software

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