Treecon ein Werkzeug, mit dem Sie phylogenetische Bäume erstellen können
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Treecon Ranking & Zusammenfassung

Treecon Stichworte

Reihenfolge Aminosäuresequenz. Aminosäure Stammbaum

Treecon Beschreibung

Treecon ist ein Softwarepaket, das hauptsächlich für den Bau und die Zeichnung von phylogenetischen Bäumen auf der Grundlage von evolutionären Entfernungen entwickelt wurde, die aus Nucleic- und Aminosäuresequenzen berechnet werden. In Abstandsmethoden wird der evolutionäre Abstand für alle Paare von Sequenzen berechnet, und ein phylogenetischer Baum wird abgeleitet, indem er die Beziehung zwischen diesen Entfernungswerten berücksichtigt. Es stehen verschiedene Algorithmen zur Verfügung, um einen phylogenetischen Baum ausgehend von diesen evolutionären Entfernungen aufzubauen, und eine Anzahl von ihnen ist in Treecon implementiert. Bei der Schätzung der evolutionären Entfernungen zwischen Sequenzen ist es bevorzugt, für überlagerte Mutationen zu korrigieren, und in dem beschriebenen Softwarepaket sind mehrere Gleichungen dafür implementiert. Programme zum Wurzeln der unrootierten Evolutionsbäume, um den Baum auf dem Bildschirm zu zeichnen, und zum Speichern des Baums sind ebenfalls enthalten, sowie mehrere andere Werkzeuge. Treecon ist einfach zu bedienen, und Vorkenntnisse über Computer ist auf ein absolutes Minimum beschränkt. Daher sollte das Paket besonders für molekulare Biologen und Evolutionisten geeignet sein, die evolutionäre Bäume auf der Grundlage ihrer eigenen molekularen Daten bauen möchten. Ausgehend von einer einfachen ASCII-Textdatei mit Nucleic- oder Aminosäuresequenzen mit Lücken, die für die gegenseitige Ausrichtung erforderlich sind, kann man publisfähige Bäume auf benutzerfreundlicher und unkomplizierter Weise erstellen. Holen Sie sich Treecon und versuche es zu sehen, wie nützlich es, dass es eigentlich für Sie sein kann! HINWEIS: Nur für den akademischen Gebrauch.

Treecon Zugehörige Software