TEAK

Analysiert molekulare Profiling-Daten und findet biologisch aktivierte Wege
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TEAK Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Thair Judeh
  • Dateigröße:
  • 191 MB

TEAK Stichworte


TEAK Beschreibung

Teakständer für Topologieanreicherungsanalyse-Framework, eine intuitive Anwendung, die zwei Komponenten umfasst: Teakholz und QSEA. Basierend auf benutzerausgewählten molekularen Profilierungsdaten kann Teak die biologisch aktivierten Subpathways ermitteln, während das QSEA-Modul QSEA (Querystrukturanreicherungsanalyse) für ein hierarchisches Abfragen der gefundenen Wege ausgelegt ist. Teakholz unterstützt mehrere Organismen (Mensch, Maus, Ratte, THALE CRESS, Nematode, Fruchtfliege), aber zusätzliche Organismen können von der Anwendung hinzugefügt werden. Es verwendet verschiedene Genetikettenschemata von KEGG, NCBI-Genid, NCBI GI und Uniprot.


TEAK Zugehörige Software