Stackmasur.

ein Plugin für die ImageJ-Bildanalyseplattform
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Stackmasur. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Babraham Bioinformatics
  • Dateigröße:
  • 92 KB

Stackmasur. Stichworte


Stackmasur. Beschreibung

StackMeasure ist ein grafisches Plugin, mit dem Sie die Funktionen von Interesse identifizieren können, und ermöglichen es Ihnen, den Abstand zwischen ihnen zu messen. Interessante Merkmale sind Gruppen von räumlich gruppierten Voxeln mit der gleichen (oder ähnlichen) Farbe. StackMeasure kann mit einer einzelnen RGB-Image-Datei mit separaten schwarzen und weißen TIFF-Dateien (einer für jeden Kanal) oder mit ZEISS-LSM-Dateien zusammenarbeiten. Mit RGB-Dateien können Sie einstellen, wie viel Flexibilität Sie in der Farbanpassung zulassen möchten, jedoch mit den anderen Formaten die Kanäle vollständig getrennt sind. StackMeasure mit dann identifizieren Sie dann einen Satz von Funktionen und geben Sie Angaben zu ihrer Position und ihrem Volumen. Es erzeugt einen zusammengesetzten Bildstapel und kann eine 3D-Version Ihres Stacks rendern, sodass Sie die Funktionen besser visualisieren können. Sobald Sie Ihre Funktionen definiert haben, können Sie die Entfernungen zwischen ihnen messen. Sie können dies entweder aus ihrem Massenzentrum oder von ihrer engsten Grenze tun. Sie können auch alle Funktionen in einem Kanal zusammenführen und den nächstgelegenen Abstand zwischen allen 2 Kanälen finden.


Stackmasur. Zugehörige Software