Squint-Ausricht-Editment-Editment Molekularausrichtungswerkzeug für Sie
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Squint-Ausricht-Editment-Editment Beschreibung

Squint ist ein Java-basiertes, fortschrittliches Ausrichtungswerkzeug. Das Programm wurde getroffen, um eine algorithmische Ausrichtung molekularer Sequenzen zusammenzubringen. Die Software ist eine Erweiterung des in Pebble verfügbaren Ausrichtungseditors. Haupteigenschaften: Import / Export-Sequenz / Ausrichtungsdaten in einer Reihe von Formaten (FASTA / NEXUS / Clustal / Phylip). Bearbeiten Sie die Platzierung der Lücken in einer Ausrichtung, wobei die Option zwei Ansichten der Daten bearbeitet werden (mit einer Ansicht, die die Daten als DNA, die beispielsweise als Aminosäure zeigt, beispielsweise als Aminosäure). Dynamisches Feedback zur Auswirkung von Änderungen der Ausrichtung an ein oder mehrere Maßnahmen der Ausrichtung der Ausrichtung. Resign entweder alle Sequenzen oder nur einen ausgewählten Bereich der Gesamtausrichtung. Führen Sie Ausrichtungen aus, die auf einem Format basieren, das sich von der von Sequenzen unterscheidet, und die Ergebnisse aufweisen, die an die ursprünglichen Daten zugeordnet sind. Richten Sie beispielsweise eine Nukleotidsequenz mit Aminosäure oder Codon aus.

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