Seeblick

Diese Anwendung kann verschiedene Ausrichtungsformate lesen und schreiben.
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Seeblick Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Manolo Gouy
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 1.1 MB

Seeblick Stichworte


Seeblick Beschreibung

Seaview ist eine Softwareanwendung, die speziell für die Untersuchung und Analyse der Sequenzausrichtungen sowie der molekularen Phylogene entwickelt wurde. Es integriert Fähigkeiten, um verschiedene Dateiformate zu lesen und zu schreiben, z. B. Nexus, MSF, Clustal, Fasta, Phylip, MASE- und NEWICK-Dateien. Portable PackageThis ist ein eigenständiges Programm, das direkt auf Ihrem Computer ausgeführt werden kann, ohne auf eine Weise installiert zu werden, die Ihre Windows-Registrierungskonfigurationsinformationen ändert. Sie können das Dienstprogramm auf beliebigen Speichergeräten wie USB-Flash-Laufwerken speichern. Das Beste, wenn Sie tragbare Tools verwenden, ist, dass Sie keine Administratorrechte benötigen, um die Programme auszuführen, da sie keine Dateien oder Einstellungen auf dem Hostcomputer verlassen. User Interfacealth Die GUI beeindruckt in der visuellen Abteilung nicht viel nicht viel, es ist eigentlich praktisch und einfach zu arbeiten. Drag-and-Drop-Support befindet sich auch auf der Funktionsliste, sodass Sie Daten schnell aus einer externen Datei importieren können. Sie können Tastenkombinationen zur Erkundung von Daten verwenden, oder drücken Sie Mausklicks, um Elemente auszuwählen und ausgewählte Sequenzen an einen anderen Ort in einer Ausrichtung zu verschieben. Das Tool kann auch mit der Befehlszeile ausgeführt werden. Importieren / Exportieren von OptionenAside aus den unterstützten Dateiformaten, die in der Einführung aufgezählt wurden, können Sie Informationen aus verschiedenen Datenbanken hinzufügen, z. B. EMBl, GenBank und SwissProt / Uniprot. Darüber hinaus können Sie die Ausrichtung in der aktuellen Datei oder exportieren Daten in eine Datei speichern, die Ausrichtung an das PDF-Dateiformat speichern (Sie erhalten die Freiheit, die Schriftart, die Block- und Papierformat zu ändern, die Farbe ändern und nur variable Sites auszugeben der Ausrichtung und ihrer Positionen). Sie dürfen eine Ausrichtung zum Ende eines anderen nach Name oder Rang hinzufügen. Bearbeiten von Funktionen und AusrichtungsoptionenSeAview bietet Ihnen die Möglichkeit, die ausgewählten Sequenzen in die Zwischenablage zu kopieren, die Ausrichtungsdaten aus der Zwischenablage einfügen, alle Sequenzen aus der Ausrichtung auszuwählen, die aktuell ausgewählte Reihenfolge umbenennen, Kommentare bearbeiten sowie eine Sequenz durch Einfügen von extern Daten oder Öffnen von zwei Bearbeitungssequenzfeldern und Übertragen von Informationen zwischen ihnen. Andere praktische Aufgaben, die auf Sequenzen angewendet werden können, beziehen sich auf das Löschen, Erstellen und Laden. Außerdem können Sie sie doppelten und umkehren, eine Punktgrog-Analyse durchführen, alle Lückenstellen aus der Ausrichtung löschen und den genetischen Code einstellen, um die ausgewählten Sequenz (en) auf Protein zu übersetzen. Wenn es um Aktionen geht, die Ihnen helfen, Ausrichtung zu verwalten, können Sie die Zielausrichtung auf allen oder ausgewählten Sequenzen, ausgewählten Sites oder einem Profil ausführen (insbesondere eine Gruppe von vorab ausgerichteten Sequenzen). Konfigurationseinstellungen und andere leistungsstarke ToolsSeAView können Sie die zur Anzeige von Sequenzen verwendete Schriftgröße festlegen, DNA-Sequenzen anzeigen, als Proteinsen anzeigen, Farbregeln für die Definition der Proteinsequenzen verwenden, Statistiken über Base- oder Aminosäuresequenzzusammensetzungen, Übergangs- und Transversionszählungen generieren, die Übergangs- und Transversionszählungen erzeugt werden. Teile einer Mehrfachausrichtung, die zur weiteren Analyse gespeichert werden sollen, erstellen und speichern Sie Spezies-Sets, wenn das MASE- oder NEXUS-Format verwendet wird, geben Sie Kommentarleitungen an der Unterseite des Bildschirms ein und führen Sie die Suche durch. Darüber hinaus können Sie DNA- oder Protein-phylogenetische Bäume oder Protein-phylogenetische Bäume planen, drucken, zeichnen, importieren, drucken, drucken und kopieren Sie phylogenetische Bäume, und führen Sie eine Analyse von zwei Sequenzen "DOT Plot" aus. Endeffekt Alles in allem erweist sich das Meerblick als ein fortgeschrittenes Programm für mehrere Sequenzausrichtung und molekulare Phylogene und eignet sich insbesondere für Stromnutzer. Bewertet von Ana Marculscu, letzte Aktualisierung am 26. September 2014


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