Satlotyper Haplotyp-Inferenz von unphasenierten SNP-Daten in heterozygoten Polyploiden basierend auf SAT
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Satlotyper Ranking & Zusammenfassung

Satlotyper Stichworte

Inferenzmotor. Fuzzy Intrerence System. Minen-SNP-Site. SNP-Site analysieren Haplotype-Schätzung. Haplotyp schätzen. Gemeinsamer Haplotyp. Haplotyp ziehen. Haplotyp malen Haplotyp. SNP-Marker Snp Tag SNP-Genotyp. Variationale Inferenz. Inferenz Haplotypbaum Haplotyp-Inferenz Boolescher Betreiber Heterozygous Polylotloide heterozygous. Inferenzwerkzeug SNP-Suche Download SNP. Filter SNP SNP-Microarrays analysieren Phylogene-Inferenz. Haplotyp beschreiben. Sequenz zum Haplotyp. Haplotypanalyse. Haplotyp-Blockanalyse. HAPLOTYPE Association Test. große Phylogene-Inferenz. SNP-Identifikation Haplotyp-Assoziation Haplotyp-Daten Y-chromosomaler Haplotyp Affymetrix-SNP-Arrays

Satlotyper Beschreibung

Satlotyper ist ein Softwaretool, das zum Inferrieren von Haplotypen aus polyloiden und polyallelen SNP-Daten ausgelegt ist. Satlotyper verwendet boolesche Operatoren und Variablen, um Haplotyp-Inferenz von Pure Parsimony (HIPP) für das boolesche Befriedigungsproblem (SAT) zu formulieren. Um den einsparsamsten Satz der Erläuterung von Haplotypen zu finden, beginnt Satlotyer mit der Annahme, dass ein Haplotyp erklärt wird, und erhöht die Anzahl der Haplotypen, bis ein ergiebiges Set gefunden wird. Da Sat NP-komplett ist, kann es nicht garantiert werden, dass eine Lösung in angemessener Zeit für eine gegebene Daten gefunden wird. Empirische Tests zeigten jedoch, dass es möglich ist, Rückschlüsse für Daten aus der realen Welt zu berechnen. Darüber hinaus gibt Satlotyper Einschränkungen für alternative Erklärungslösungen und kann die Wahrscheinlichkeit des Ergebnisses durch ein Bootstrapping-Verfahren optimieren. Gib Satlotyper ein, um zu sehen, wie nützlich es, dass es eigentlich für dich sein kann!

Satlotyper Zugehörige Software